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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002144`

染色体: Chr08 坐标: 19306466-19310473 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002144`
名称	SmilChr08G002144
描述	uncharacterized SmilChr08G002144
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19306466 - 19310473 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998164`
GeneID	`130998164`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998164`
原始查询	`LOC130998164`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0359000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0359000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G38660` (APE1) acclimation of photosynthesis to environment [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833856] identity=79.8; qcov=0.717; evalue=1.59e-116; confidence=high
Rice	`Os08g0359000` - identity=86.3; qcov=0.714; evalue=2.36e-126; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11016 (DUF2854)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998164

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057779578.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057779578.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.80000	`XP_057779578.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057779578.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779578.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19306533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr8:19306569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:19306570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:19306575`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	A6
`Chr8:19306575`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A6
`Chr8:19306704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:19307121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,B90,B92
`Chr8:19307744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:19310132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,B3,B45,B59,C52
`Chr8:19310278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779578.1

276 aa

138

276

DUF2854

PF11016 DUF2854 108-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779578.1`	Pfam	`PF11016`	DUF2854	Family	108	258	4.4e-48	163.6	Protein of unknown function (DUF2854)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923595.1
CATCCGCGGCGGGGATGGTGGCAGGATGCGGCGGCGGCGGCGGAATACTTGTCCGATCGCCGGGCTGCACCTGTCTACCCTGTTTTGCTTCTTCTAGGATTCCCGGACCCTAACCTATCCAATCGTCACAGCCTATCTCCACTCAAAACCCATCTTAAATTGTACCGGAGCCCTAGATTGGCTCGAGCTGCCGAGTCAACTCCGTCGTCTTCCATTGCCTCTGGTAATGCTGACAAGTCAGTCGTCCCCGATGCTGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998164
CATCCGCGGCGGGGATGGTGGCAGGATGCGGCGGCGGCGGCGGAATACTTGTCCGATCGCCGGGCTGCACCTGTCTACCCTGTTTTGCTTCTTCTAGGATTCCCGGACCCTAACCTATCCAATCGTCACAGCCTATCTCCACTCAAAACCCATCTTAAATTGTACCGGAGCCCTAGATTGGCTCGAGCTGCCGAGTCAACTCCGTCGTCTTCCATTGCCTCTGGTAATGCTGACAAGTCAGTCGTCCCCGATGCTGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779578.1
HPRRGWWQDAAAAAEYLSDRRAAPVYPVLLLLGFPDPNLSNRHSLSPLKTHLKLYRSPRLARAAESTPSSSIASGNADKSVVPDAEFTLAKVSFGVIGLGLGVSLLSYGFGAYFNILPGSEWSALMLTYGFPLAIIGMALKYAELKPVPCVTYSDALALREKCSTPILNQVRNDVTRYRYGDEQHLDEALKRIFQYSQGGGIPRRSAPILQNIREEVTEDGRYSLVLIFEAKALELSDFEKRKAKFASFFGPGITAEISE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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