当前解析结果
SmilChr08G002240| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002240 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002240 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002240 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 20550070 - 20551079 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998177 |
|---|---|
| GeneID | 130998177 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998177 |
| 原始查询 | LOC130998177 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998177 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057779592.1 |
| 2 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057779592.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779592.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779592.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779592.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:20550327 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B103,B128,C40,C83 |
Chr8:20550342 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B110 |
Chr8:20550342 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B110 |
Chr8:20550458 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B3,B86 |
Chr8:20550534 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A15 |
Chr8:20550534 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr8:20550536 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr8:20550664 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 51 | A10,A15,A16,A2,A20,A25,A3,B101,B105,B113,B117,B131,B140,B23,B29,B32,B38,B40,B64,B78,B81,B86,B90,B94,B97,C1,C12,C14,C28,C31,C4,C40,C46,C5,C50,C51,C58,C59,C62,C63,C65,C67,C7,C75,C78,C80,C83,D2,D6,D8,D9 |
Chr8:20550665 |
GCA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 51 | A10,A15,A16,A2,A20,A25,A3,B101,B105,B113,B117,B131,B140,B23,B29,B32,B38,B40,B64,B78,B81,B86,B90,B94,B97,C1,C12,C14,C28,C31,C4,C40,C46,C5,C50,C51,C58,C59,C62,C63,C65,C67,C7,C75,C78,C80,C83,D2,D6,D8,D9 |
Chr8:20550669 |
C |
CT |
1bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 49 | A10,A15,A16,A2,A20,A25,A3,B101,B113,B117,B131,B140,B23,B29,B32,B38,B40,B64,B78,B81,B86,B90,B94,B97,C1,C12,C14,C28,C31,C4,C40,C46,C5,C50,C51,C58,C59,C62,C63,C67,C7,C75,C78,C80,C83,D2,D6,D8,D9 |
Chr8:20550683 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 48 | A10,A15,A16,A2,A20,A25,A3,B101,B113,B117,B131,B140,B23,B29,B32,B38,B40,B64,B78,B81,B90,B94,B97,C1,C12,C14,C28,C31,C4,C40,C46,C5,C50,C51,C58,C59,C62,C63,C67,C7,C75,C78,C80,C83,D2,D6,D8,D9 |
Chr8:20550978 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 17 | A15,A20,A8,B1,B104,B105,B111,B13,B16,B21,B28,B36,B51,C40,C42,C8,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。