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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002370`

染色体: Chr08 坐标: 22519547-22521911 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002370`
名称	SmilChr08G002370
描述	uncharacterized SmilChr08G002370
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22519547 - 22521911 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998200`
GeneID	`130998200`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998200`
原始查询	`LOC130998200`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.8; qcov=0.831; evalue=7.97e-57; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=28.8; qcov=0.84; evalue=1.02e-65; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998200

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779613.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779613.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779613.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779613.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779613.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22519547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr8:22519575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:22519590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr8:22519667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:22519686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:22519707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr8:22519766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr8:22519846`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B65
`Chr8:22519846`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B65
`Chr8:22519847`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65
`Chr8:22519847`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B65
`Chr8:22519849`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779613.1

682 aa

341

682

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 297-391 aa PF00872 Transposase_mut 314-467 aa PF04434 SWIM 542-572 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779613.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	297	391	3.1e-19	69.9	MULE transposase domain
`XP_057779613.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	314	467	3e-11	43.5	Transposase, Mutator family
`XP_057779613.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	542	572	6.6e-08	32.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923630.1
ATGGAGGTGAATCCAGTGCACAATTCGAAGTCAACGGGTTGGACTTCATGGGATGAGCCAAATCCGTACCAGTACGATCGCCCAACAACTGATCGTTGTTGGGGTCCAGCTGATGATCAATATACGTATGAGCCTCAGTTTGTGGAGGATGCTGGTAATGTAGATGAAGATTATGTTCCATCGTCTGAAGCCGAGACTGATACAAGCGCCTCTGAAGACTTGTCGGAGCCAGAGAACGTGAGAAGGGCGGGGATTGAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998200
ATGGAGGTGAATCCAGTGCACAATTCGAAGTCAACGGGTTGGACTTCATGGGATGAGCCAAATCCGTACCAGTACGATCGCCCAACAACTGATCGTTGTTGGGGTCCAGCTGATGATCAATATACGTATGAGCCTCAGTTTGTGGAGGATGCTGGTAATGTAGATGAAGATTATGTTCCATCGTCTGAAGCCGAGACTGATACAAGCGCCTCTGAAGACTTGTCGGAGCCAGAGAACGTGAGAAGGGCGGGGATTGAATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779613.1
MEVNPVHNSKSTGWTSWDEPNPYQYDRPTTDRCWGPADDQYTYEPQFVEDAGNVDEDYVPSSEAETDTSASEDLSEPENVRRAGIEYADWQNLQIDEDDDEQVPGADELTNWLVPVIPLDAAAALGKEFSVSKSDSRRVYFKCKHSDMCPFKLHASSQDGVIWGVYKFTNEHSCDGELGRVARIKAPAKVVAAYLAQKIHDDCEILKPKAIQLELRREFGVQIKYDVALRARNRATEMVYGRHDQSFEMLPKYLYMLRQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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