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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002417`

染色体: Chr08 坐标: 22972195-22974167 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002417`
名称	SmilChr08G002417
描述	uncharacterized SmilChr08G002417
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22972195 - 22974167 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998206`
GeneID	`130998206`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998206`
原始查询	`LOC130998206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=27.2; qcov=0.933; evalue=4.1e-30; confidence=low
Rice	`gene-orf258` (orf258) - identity=27.3; qcov=0.473; evalue=1.36e-16; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998206

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779619.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779619.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057779619.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779619.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22973045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B125
`Chr8:22973058`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A21,A9,B104,B119,B123,B134,B87
`Chr8:22973086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B139,C18,C27
`Chr8:22973110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B7,D3
`Chr8:22973118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B139,C18,C27
`Chr8:22973133`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A1,B105,B118,B124,B130,B139,B21,B56,B75,B96,C18,C26,C27,C83
`Chr8:22973149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr8:22973152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B7,D3
`Chr8:22973153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:22973173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B125,B90,B92,D6
`Chr8:22973214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B7,D3
`Chr8:22973217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779619.1

433 aa

216

433

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 55-148 aa PF13456 RVT_3 259-368 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779619.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	55	148	4.2e-16	60.1	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057779619.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	259	368	6.5e-21	75.2	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923636.1
ATGAGAGTGAATGATCTGTTTGAGGAAGATACAACGACATGGGACGGGAAAAAAGTGTTGGCTATGGTCGACTCAAGGGATGGTTGGAAGATTCTCTCACAACTGCATGGGAGGATGGATGGACCGGACCTTCCCTTTTGGCTCCATGGTAAGCTGAATATGTATACTGTTAAGTCGGGTTACTGGTTGGCGAGCTTACGAAGGAGAAGGGCCGATCCTTCTACTTCGGATCAGTTTAAGGATCTATGGAAGTGGATTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998206
ATGAGAGTGAATGATCTGTTTGAGGAAGATACAACGACATGGGACGGGAAAAAAGTGTTGGCTATGGTCGACTCAAGGGATGGTTGGAAGATTCTCTCACAACTGCATGGGAGGATGGATGGACCGGACCTTCCCTTTTGGCTCCATGGTAAGCTGAATATGTATACTGTTAAGTCGGGTTACTGGTTGGCGAGCTTACGAAGGAGAAGGGCCGATCCTTCTACTTCGGATCAGTTTAAGGATCTATGGAAGTGGATTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779619.1
MRVNDLFEEDTTTWDGKKVLAMVDSRDGWKILSQLHGRMDGPDLPFWLHGKLNMYTVKSGYWLASLRRRRADPSTSDQFKDLWKWIWSLEVIPKVKMFMWKCLAEALPTNTALRKKSIDLDPMCRRCGNGIETMEHALRDCVWMKVLWAVSPLLLPPILEAEICPIQAWFERIRSVPHKEIHATFASIAWAVWYTRNLLVFQGKETDHKECLTIAHRGTWPKTVCENPKFSMPTRIFCSRPGQLKVACDAAVAPNFGIGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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