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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002556`

染色体: Chr08 坐标: 24866849-24868414 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002556`
名称	SmilChr08G002556
描述	uncharacterized SmilChr08G002556
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	24866849 - 24868414 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998231`
GeneID	`130998231`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998231`
原始查询	`LOC130998231`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=52.8; qcov=0.323; evalue=2.99e-37; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=52.4; qcov=0.972; evalue=1.53e-145; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998231

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779645.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057779645.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779645.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779645.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779645.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:24866908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	155	A1,A10,A11,A14,A18,A2,A20,A23,A25,A3,A4,A5,A7,A8,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B110,B111,B115,B118,B119,B120,B124,B125,B126,B130,B134,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B19,B21,B22,B24,B26,B28,B29,B3,B30,B34,B36,B38,B41,B44,B45,B46,B47,B51,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B62,B64,B68,B70,B73,B74,B75,B77,B79,B80,B81,B82,B84,B87,B89,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C17,C18,C19,C21,C23,C25,C26,C28,C29,C3,C32,C36,C37,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C68,C69,C71,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D2,D3,D5,D7,D8
`Chr8:24866909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A23,A4,B16,B22,B34,B96,C23,C73,C84
`Chr8:24866949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C57,D6
`Chr8:24866967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B110,B25,B47,C56,C64,C66,D3
`Chr8:24867008`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	128	A10,A11,A15,A18,A2,A20,A23,A4,A5,A8,A9,B1,B100,B101,B106,B107,B11,B118,B119,B121,B123,B126,B128,B13,B130,B134,B135,B139,B14,B15,B16,B17,B19,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B3,B33,B34,B35,B38,B41,B42,B44,B46,B47,B48,B51,B57,B60,B63,B65,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B80,B81,B82,B87,B89,B90,B93,B95,B96,B97,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C19,C20,C25,C27,C29,C3,C31,C35,C36,C38,C40,C41,C42,C43,C46,C47,C5,C51,C52,C54,C58,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C76,C77,C8,C80,C82,C83,C84,C85,D11,D3,D4,D5
`Chr8:24867027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B108,B84,C23
`Chr8:24867059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B84,C23
`Chr8:24867063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A20,B138,C8
`Chr8:24867105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B101,B132
`Chr8:24867107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:24867108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	120	A10,A11,A18,A19,A2,A20,A21,A25,A5,A6,A7,A8,B10,B104,B105,B107,B11,B111,B114,B118,B121,B124,B130,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B20,B24,B26,B27,B28,B29,B30,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B46,B49,B50,B51,B56,B63,B65,B73,B74,B75,B79,B8,B82,B83,B84,B85,B87,B89,B90,B91,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C18,C19,C2,C21,C23,C24,C25,C28,C29,C3,C31,C32,C36,C38,C39,C40,C41,C43,C45,C51,C53,C54,C55,C56,C59,C60,C61,C63,C65,C68,C74,C76,C78,C79,C83,C84,C85,D1,D10,D3,D5,D9
`Chr8:24867118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B51,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779645.1

393 aa

196

393

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 13-52 aa PF04827 Plant_tran 121-323 aa PF13359 DDE_Tnp_4 150-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779645.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	13	52	2.6e-22	79.0	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057779645.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	121	323	2.3e-106	354.7	Plant transposon protein
`XP_057779645.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	150	313	7.5e-11	42.6	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923662.1
ATGGAAATTCCTCAACCCAGCATGGAACGTGAGTTTGGTGCAGAGCGTTTGATCAACGACTACTTCAGCGACAACCCAACGTATACTCCAGAGCTTTTCCGACGGAGATTTCGCATGCAGAAATCGCTATTCATTCGAATAGTGGAAGCTGTTACTGCTAATGATGAGTTTTTTCAACAGAGACGAGATGCCACCGGCAGAGTAGGTCTTTCATCATTGCAGAAATGTACTGGAGCCATGAGGGTGTTGGCGTATGGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998231
ATGGAAATTCCTCAACCCAGCATGGAACGTGAGTTTGGTGCAGAGCGTTTGATCAACGACTACTTCAGCGACAACCCAACGTATACTCCAGAGCTTTTCCGACGGAGATTTCGCATGCAGAAATCGCTATTCATTCGAATAGTGGAAGCTGTTACTGCTAATGATGAGTTTTTTCAACAGAGACGAGATGCCACCGGCAGAGTAGGTCTTTCATCATTGCAGAAATGTACTGGAGCCATGAGGGTGTTGGCGTATGGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779645.1
MEIPQPSMEREFGAERLINDYFSDNPTYTPELFRRRFRMQKSLFIRIVEAVTANDEFFQQRRDATGRVGLSSLQKCTGAMRVLAYGTSTDVVDEYLRMSSSSTRDALVHFVEGVISCFGGTYLRRPNEEDLARLLYVGEQRGFPGMIGSIDCMHWEWKNCPNAWAGQYTGRSGKPTIILEVVASYDLWIWHAFFGTPGSCNDINVLHRSPVFNDVLEGRAPKVNYVVNGRHYDKAYYLTDGIYPSWAVFVKSITSPQIRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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