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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002580`

染色体: Chr08 坐标: 25139545-25140528 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002580`
名称	SmilChr08G002580
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25139545 - 25140528 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998236`
GeneID	`130998236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998236`
原始查询	`LOC130998236`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=high
产物	orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G23160` (CRK8) cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415] identity=42.3; qcov=0.853; evalue=9.2e-71; confidence=medium
Rice	`gene-orf490` (orf490) - identity=48.7; qcov=0.924; evalue=6.3e-99; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779651.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779651.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779651.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779651.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779651.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25139583`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A24,B10,B123,B128,B130,B14,B17,B26,B37,B45,B55,B6,B85,B88,B9,B90,B92,B99,C44,C53,C56,C58,C61,C84,C87,D10,D11
`Chr8:25139620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B48,B57,B79,C76
`Chr8:25139640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B108,B131,C45,D6
`Chr8:25139649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:25139686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:25139698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:25139794`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	87	A21,A23,A24,A25,A4,A5,A7,B10,B103,B107,B121,B123,B124,B128,B13,B130,B132,B133,B135,B136,B138,B14,B17,B2,B23,B26,B28,B34,B35,B37,B40,B41,B45,B46,B47,B50,B51,B52,B54,B55,B57,B6,B60,B61,B65,B67,B7,B73,B77,B80,B82,B85,B88,B9,B90,B92,B99,C11,C20,C23,C24,C33,C40,C41,C44,C49,C50,C52,C53,C56,C58,C60,C61,C64,C66,C69,C73,C74,C76,C78,C84,C87,D10,D11,D4,D5,D8
`Chr8:25139828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B121
`Chr8:25139828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr8:25139957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:25139982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr8:25140009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779651.1

327 aa

164

327

RVT_2

PF07727 RVT_2 5-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779651.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	5	88	1.6e-15	58.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923668.1
ATGCGTAAAGATGGCAAACTCATGATTCTGTTGGTCTATGTTGATGATATCCTCCTTACTGGAGAAGATTCTACTCAAATTTCTCAGTTCATACAGACTTTATCCCAGAAGTTTGCACTCAAAACTCTTGGCACGGTGAATTTCTTCCTCGGTATCCATGTCTTCAAAACCCGCAACAACTCCTATCTTCTCAATCAATCAAAGTATATCCATGACCTTCTCTCCAAAACAAAGCTACTTAACTGCAAATCTCAACCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998236
ATGCGTAAAGATGGCAAACTCATGATTCTGTTGGTCTATGTTGATGATATCCTCCTTACTGGAGAAGATTCTACTCAAATTTCTCAGTTCATACAGACTTTATCCCAGAAGTTTGCACTCAAAACTCTTGGCACGGTGAATTTCTTCCTCGGTATCCATGTCTTCAAAACCCGCAACAACTCCTATCTTCTCAATCAATCAAAGTATATCCATGACCTTCTCTCCAAAACAAAGCTACTTAACTGCAAATCTCAACCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779651.1
MRKDGKLMILLVYVDDILLTGEDSTQISQFIQTLSQKFALKTLGTVNFFLGIHVFKTRNNSYLLNQSKYIHDLLSKTKLLNCKSQPSPYDISSKLSKHDSPSFSNPTLYQSTIGALQYLTLTRPDISYSVNKLSQFLKEPTENHWKACKRLLRYLKGTINKSLIFTSSSLLHLQVFSDADWAGSIDDRKSTGGHCVFLGPNLLSWSSKKQSVVSRSSTESEYRSLADAAAEVVWIKSLIHELGFSISHTPVLWCDNQSTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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