当前解析结果
SmilChr08G002644| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002644 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002644 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002644 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 25917270 - 25918804 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998244 |
|---|---|
| GeneID | 130998244 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998244 |
| 原始查询 | LOC130998244 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998244 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779659.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779659.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779659.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779659.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057779659.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:25918095 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 22 | A13,A20,A9,B1,B100,B109,B127,B131,B55,B61,B66,B79,B90,B98,C19,C27,C30,C33,C34,C49,C6,C85 |
Chr8:25918127 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr8:25918350 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,D5 |
Chr8:25918352 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr8:25918354 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,C79 |
Chr8:25918379 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A22,C16,C33,C52,C55 |
Chr8:25918379 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,C16,C33,C52,C55 |
Chr8:25918441 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B51 |
Chr8:25918536 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C16,C37 |
Chr8:25918610 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A5,B49,B79 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。