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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002657`

染色体: Chr08 坐标: 26041649-26042323 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002657`
名称	SmilChr08G002657
描述	uncharacterized SmilChr08G002657
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26041649 - 26042323 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998247`
GeneID	`130998247`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998247`
原始查询	`LOC130998247`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=24.5; qcov=0.71; evalue=6.79e-08; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.5; qcov=0.656; evalue=5.22e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998247

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779662.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057779662.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057779662.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779662.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779662.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26041667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C51,C63,C67
`Chr8:26041670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B7,B80
`Chr8:26041675`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A1,A25,B140,B18,B21,B53,B59,B66,B8,B83,C49,C82
`Chr8:26041676`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	75	A10,A19,A21,A22,A4,A7,A8,A9,B1,B110,B118,B121,B129,B130,B131,B132,B133,B136,B137,B19,B20,B24,B25,B27,B29,B3,B34,B41,B42,B43,B44,B45,B51,B54,B56,B57,B58,B62,B63,B67,B69,B75,B82,B84,B86,B9,B94,B96,C14,C18,C20,C25,C28,C30,C31,C39,C41,C44,C51,C53,C54,C57,C59,C6,C64,C65,C66,C70,C71,C78,C84,C85,C86,D5,D7
`Chr8:26041714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:26041738`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A1,B140,B18,B21,B8,B83,C49,C82
`Chr8:26041755`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B21,C6
`Chr8:26041755`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B21,C6
`Chr8:26041760`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B38,B44,C38
`Chr8:26041760`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B38,B44,C38
`Chr8:26041773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr8:26041806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779662.1

224 aa

112

224

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 51-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779662.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	51	120	3.2e-14	54.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923679.1
ATGACAAATCTTGGATCCGTTCCCATAGAAAAAAAATGGGGGTTGGGTGACCGCGGCGGGTTGGGGATAATACTTGCAGAGTTGCAGACAAACAAGAAAAGAAAGTTGGGGAGGGATAATACTAGCACGTTCGTTATTAGAAACAGGGAAGCATTGGCAAAGATTTGGGATGCACCTGCCCCACATAAAGCAAAAGTTTGTGCATGGAGGATTTTGAGAAGTCGGCTTCCAACTTGTGACAACCTTTGGAAGAGGAAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998247
ATGACAAATCTTGGATCCGTTCCCATAGAAAAAAAATGGGGGTTGGGTGACCGCGGCGGGTTGGGGATAATACTTGCAGAGTTGCAGACAAACAAGAAAAGAAAGTTGGGGAGGGATAATACTAGCACGTTCGTTATTAGAAACAGGGAAGCATTGGCAAAGATTTGGGATGCACCTGCCCCACATAAAGCAAAAGTTTGTGCATGGAGGATTTTGAGAAGTCGGCTTCCAACTTGTGACAACCTTTGGAAGAGGAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779662.1
MTNLGSVPIEKKWGLGDRGGLGIILAELQTNKKRKLGRDNTSTFVIRNREALAKIWDAPAPHKAKVCAWRILRSRLPTCDNLWKRKVKLNEEEMMCNACFHSPESIDHVFLACPKTGLVWDEVQKWLGSSSVRPRHISSHFEMFTKLGRGKNCDKFLEAMWMCITWVLWKQRNASRFDGKAWNIKGTLMEIKARSWSWFKEFKTLEKDFDFCNWCSFDLLPKLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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