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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002686`

染色体: Chr08 坐标: 26476623-26477450 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002686`
名称	SmilChr08G002686
描述	uncharacterized SmilChr08G002686
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26476623 - 26477450 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998253`
GeneID	`130998253`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998253`
原始查询	`LOC130998253`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=32.3; qcov=0.338; evalue=2.3e-10; confidence=low
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998253

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779668.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779668.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779668.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779668.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779668.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26476656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B64,C47
`Chr8:26476677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B29,B58
`Chr8:26476694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C14
`Chr8:26476694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:26476716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:26476745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A1,A14,A15,A25,A4,A9,B132,B134,B140,B18,B2,B21,B31,B59,B74,B83,C2,C51,C63,C65,C67,C73,C82,D11,D2,D3
`Chr8:26476876`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B115,B13,B130,B28,B53,B77,B88,C42,C46,C49,C81,D10
`Chr8:26476889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B78,C45,C80,D4
`Chr8:26476906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:26476908`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B112,B120,B124,B17,B51,C35,C37,C57,C86
`Chr8:26476916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:26476926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B137,B33,C23,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923685.1
ATGACCGACGCACCCTATCCAGGACGCCTGAGACAGAAAGCTAAAGAGAAGGAAGCAAGTGAAATGATGAAGATGTTCCAGAAAGTGGAGTTAAGCATACCCTTACTCGACGCTATCAGACAAATTCCAAAGTATGCTAAATTCTTGAAGGACCTTTGTTCGAGAAAAGTGAAGATGGATGAAGAAGTCCGCTATGTGATGGGAGAGAGTGTCTCGGCGGTGATCCAACGGAAGTTGCCCACGAAGCGGAAGGACCCAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998253
ATGACCGACGCACCCTATCCAGGACGCCTGAGACAGAAAGCTAAAGAGAAGGAAGCAAGTGAAATGATGAAGATGTTCCAGAAAGTGGAGTTAAGCATACCCTTACTCGACGCTATCAGACAAATTCCAAAGTATGCTAAATTCTTGAAGGACCTTTGTTCGAGAAAAGTGAAGATGGATGAAGAAGTCCGCTATGTGATGGGAGAGAGTGTCTCGGCGGTGATCCAACGGAAGTTGCCCACGAAGCGGAAGGACCCAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779668.1
MTDAPYPGRLRQKAKEKEASEMMKMFQKVELSIPLLDAIRQIPKYAKFLKDLCSRKVKMDEEVRYVMGESVSAVIQRKLPTKRKDPGMFTIPCNIGGTNMDKAMMDLGASINVMSLAVYKRFNIGEMRNTRVVIQLADRCNAYPEGVVEDVLIKVGDLIFPADFYVLDTGPETGENAILLGRPFMMTAGTKIDMKTEILTCEFDGIHEEFNIYETMKRKQSMETVDMIDVFEPLVQEQGIGFGSGDATEKVIQYGLTDRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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