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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002776`

染色体: Chr08 坐标: 27477385-27477960 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002776`
名称	SmilChr08G002776
描述	uncharacterized SmilChr08G002776
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27477385 - 27477960 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998265`
GeneID	`130998265`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998265`
原始查询	`LOC130998265`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=52.1; qcov=0.733; evalue=5.98e-33; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=44; qcov=0.963; evalue=4.07e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998265

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779680.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057779680.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779680.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779680.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779680.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27477453`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B79,C6,C80
`Chr8:27477453`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B79,C6,C80
`Chr8:27477460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C52
`Chr8:27477460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:27477469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B106,B61,B78,C22,C65
`Chr8:27477469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B61,B78,C22,C65
`Chr8:27477484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:27477486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:27477490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B46
`Chr8:27477500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B74,C2
`Chr8:27477507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B83,B98
`Chr8:27477511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779680.1

191 aa

191

DUF8418

PF28509 DUF8418 58-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779680.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	58	96	7.1e-17	61.6	Domain of unknown function (DUF8418)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923697.1
ATGTCTTCCTCTTCATCAAGCCACGAGGATGAGCGACATGCTCAAGAATTTTCCAATCTTGTGCAAGAATTTAATCAAATTGTTCAAGATATTGGTGATCCGAATGCGCAACCTCGTCGGCGGCGACGAAGAGTGGCAAAGAAGGCCTACATTCATCGGGACCGTGAAGCCGGCGCTCTACGTTTGCACGTGGATTACTTTGCTGAAAATCTGGTCTACCCCGACAACGTCTTCCGCCGCCGATTTTGTATGCGTCGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998265
ATGTCTTCCTCTTCATCAAGCCACGAGGATGAGCGACATGCTCAAGAATTTTCCAATCTTGTGCAAGAATTTAATCAAATTGTTCAAGATATTGGTGATCCGAATGCGCAACCTCGTCGGCGGCGACGAAGAGTGGCAAAGAAGGCCTACATTCATCGGGACCGTGAAGCCGGCGCTCTACGTTTGCACGTGGATTACTTTGCTGAAAATCTGGTCTACCCCGACAACGTCTTCCGCCGCCGATTTTGTATGCGTCGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779680.1
MSSSSSSHEDERHAQEFSNLVQEFNQIVQDIGDPNAQPRRRRRRVAKKAYIHRDREAGALRLHVDYFAENLVYPDNVFRRRFCMRRVLFLRIVNVVASDPYFQQRTDALGRPSFTPLQNCTVAVRMLANGGAADQYDEYLRIAESTSLECLRRFCRAIIHLFGAEYLRRPTSVDCQRLLAMHEAKHGFPGC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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