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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002821`

染色体: Chr08 坐标: 28027044-28028009 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002821`
名称	SmilChr08G002821
描述	uncharacterized SmilChr08G002821
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28027044 - 28028009 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998274`
GeneID	`130998274`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998274`
原始查询	`LOC130998274`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=22.1; qcov=0.592; evalue=1.21e-06; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=24.3; qcov=0.935; evalue=3.91e-12; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998274

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779689.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779689.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057779689.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779689.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779689.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28027077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B134,B14,B57,C54
`Chr8:28027077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B14,B57,C54
`Chr8:28027090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:28027154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B85
`Chr8:28027205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B31,B48,B49,B79,C26,C39
`Chr8:28027206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A19,A8,B1,B100,B105,B108,B115,B127,B15,B27,B47,B50,B59,C20,C22,C25,C29,C70,C77,D9
`Chr8:28027221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr8:28027221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:28027233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B77,C13
`Chr8:28027258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C13
`Chr8:28027260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:28027298`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A4,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779689.1

321 aa

160

321

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 123-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779689.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	123	217	1.4e-16	61.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923706.1
ATGGTAAATATAGGACAGGGTGGTTCCTTGAGTGGGGAAATCCAGAACAGGTGGTTTTGGAACAATATTAAGCGTAAAATTGGAAACGGGAGGACCACAAAATTCTGGGAGCATGGGTGGACGGGCACAAGACCTCTAAAGCTTGAATTCCCTAGACTTTTCCAACTAACTGAAAATAAGGAGGCAACAATTAGTGAATTCGGAAAGTGGGAGAACGGAGGTTGGATTTGGGAGTTGAAGTGGAGGCGGGATCTTTTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998274
ATGGTAAATATAGGACAGGGTGGTTCCTTGAGTGGGGAAATCCAGAACAGGTGGTTTTGGAACAATATTAAGCGTAAAATTGGAAACGGGAGGACCACAAAATTCTGGGAGCATGGGTGGACGGGCACAAGACCTCTAAAGCTTGAATTCCCTAGACTTTTCCAACTAACTGAAAATAAGGAGGCAACAATTAGTGAATTCGGAAAGTGGGAGAACGGAGGTTGGATTTGGGAGTTGAAGTGGAGGCGGGATCTTTTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779689.1
MVNIGQGGSLSGEIQNRWFWNNIKRKIGNGRTTKFWEHGWTGTRPLKLEFPRLFQLTENKEATISEFGKWENGGWIWELKWRRDLFQREIEASNELLSSISSVSLVAGNEDGWCWRATKNETFSTKSAYELIKATRNQDLTAHPNKDLIAKVWDTPAPQKARVTAWRALRNRLPTCNNLVKRNIQLGVEEVMCNAYFHQVESANHCFLTCPKAEVIWNSIYQWLGITDVRQQCVVAHLESFAHLGRSKRSRKFLTTLWMC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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