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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002867`

染色体: Chr08 坐标: 28517957-28518929 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002867`
名称	SmilChr08G002867
描述	uncharacterized SmilChr08G002867
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28517957 - 28518929 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998279`
GeneID	`130998279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998279`
原始查询	`LOC130998279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=26.5; qcov=0.727; evalue=1.28e-06; confidence=low
Rice	`Os01g0685100` - identity=25.5; qcov=0.426; evalue=2.47e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779694.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779694.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057779694.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779694.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28517966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B79
`Chr8:28517968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:28517991`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	54	A19,A20,A21,A23,A4,A8,B110,B111,B115,B12,B124,B130,B136,B137,B138,B139,B18,B20,B24,B35,B38,B4,B47,B48,B54,B56,B59,B62,B65,B66,B7,B8,B80,B86,B91,B96,B98,C18,C20,C23,C24,C27,C33,C44,C45,C54,C55,C61,C7,C73,C76,C80,C81,C9
`Chr8:28517994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,B51
`Chr8:28517996`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A22,B104,B110,B19,C11,C74,D3
`Chr8:28517997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C10
`Chr8:28517999`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A16,A24,A5,B109,B123,B126,B26,B27,B33,B43,B57,B67,B69,B73,B78,B81,B83,B90,B92,C21,C24,C31,C36,C58,C59,C78,D1,D5
`Chr8:28518085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B119,B128,C10,C12,C17,C38,C58,C83,D9
`Chr8:28518130`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C6
`Chr8:28518130`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C6
`Chr8:28518140`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A24,B101,B107,B108,B12,B129,B19,B32,B41,B51,B56,B71,B75,B77,B89,B95,B98,C1,C13,C35,C4,C50,C61,C7,C70,C71,C86
`Chr8:28518145`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B121,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923711.1
ATGGAAAAGGAGGATGGTGGCCGAAAATTGTGGCTAGGGGGGGGAGGGGGCGAGTGGTGGGCTGGCGAGAAACCTCTTAGGGCTGTTTTCCCGAGACTTTTTCATTTGTGTCTTAATAAAGAAGCTGTGATCGAGCACTACGGGAGATGGGAAGACGGGAAGTGGACCTGTGATATTAAGTGGAGGAGGGAACTATTCGGGAGAGATCTTGGGGAGCTTAATACTCTGCTCTTGGCTATTTCTCCTTTCTCTCTGAATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998279
ATGGAAAAGGAGGATGGTGGCCGAAAATTGTGGCTAGGGGGGGGAGGGGGCGAGTGGTGGGCTGGCGAGAAACCTCTTAGGGCTGTTTTCCCGAGACTTTTTCATTTGTGTCTTAATAAAGAAGCTGTGATCGAGCACTACGGGAGATGGGAAGACGGGAAGTGGACCTGTGATATTAAGTGGAGGAGGGAACTATTCGGGAGAGATCTTGGGGAGCTTAATACTCTGCTCTTGGCTATTTCTCCTTTCTCTCTGAATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779694.1
MEKEDGGRKLWLGGGGGEWWAGEKPLRAVFPRLFHLCLNKEAVIEHYGRWEDGKWTCDIKWRRELFGRDLGELNTLLLAISPFSLNAGMADCSKDGVFSTKSAYSILTETWTESSMPANVKKASSKVLKVPAPHKPKNIPLAIEESYCTSCVASLETANHLFLLCPKAGKVWDEIKKWLGIFTTRPQGIIQHLFSFSNLGGGKKSCKFLKALWMCTIWLLWKGRNEGRFEGKFGARVIWYRCSLSCVAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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