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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002900`

染色体: Chr08 坐标: 28974347-28976583 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002900`
名称	SmilChr08G002900
描述	3'-5' exonuclease-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28974347 - 28976583 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998288`
GeneID	`130998288`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998288`
原始查询	`LOC130998288`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3'-5' exonuclease-like
产物	3'-5' exonuclease-like
Arabidopsis	`AT2G36110` (AT2G36110) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818184] identity=34.2; qcov=0.87; evalue=2.64e-24; confidence=low
Rice	`Os01g0300000` - identity=46.1; qcov=0.888; evalue=7.67e-55; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006139 (nucleobase-containing compound metabolic process); GO:0008408 (3'-5' exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF01612 (DNA_pol_A_exo1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998288

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779703.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779703.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779703.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779703.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779703.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28976043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C87,D7
`Chr8:28976078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A5,B107,B126,B133,B3,B42,B43,B64,B81,C11,C2,C21,C35,C58,C69,C84
`Chr8:28976148`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	B103,B109,B128,B13,B130,B16,B24,B44,B49,B52,B53,B62,B69,B78,B84,B86,B99,C10,C16,C20,C22,C28,C30,C4,C41,C53,C79,C85,C87,D11,D4,D6
`Chr8:28976394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr8:28976442`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr8:28976442`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B82
`Chr8:28976534`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B82
`Chr8:28976534`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B82
`Chr8:28976536`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr8:28976536`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779703.1

215 aa

108

215

DNA_pol_A_exo1

PF01612 DNA_pol_A_exo1 56-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779703.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	56	215	2.8e-19	70.3	3'-5' exonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923720.1
ATGGCTGGGTACCTTAGACTCAATCATCATAGCTCGGGTCATTTCAAGCAAGATTCTATTCTTTCGTTCGGCAACACCGTTTTGTTCAGGGGAACAACCATCGAGACCACCGTCACCGACAAGGCCGCCACCGCCTCCGACTGGGCCGGCGAGATCACCGCCCTCTACGGCGGCAGCCCCGCGGTGGTGGGCCTCGACGTGGAGTGGCGGCCCCACCACATCAGCTACATGAGCAACAAGTCGGCCACACTTCAGCTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998288
ATGGCTGGGTACCTTAGACTCAATCATCATAGCTCGGGTCATTTCAAGCAAGATTCTATTCTTTCGTTCGGCAACACCGTTTTGTTCAGGGGAACAACCATCGAGACCACCGTCACCGACAAGGCCGCCACCGCCTCCGACTGGGCCGGCGAGATCACCGCCCTCTACGGCGGCAGCCCCGCGGTGGTGGGCCTCGACGTGGAGTGGCGGCCCCACCACATCAGCTACATGAGCAACAAGTCGGCCACACTTCAGCTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779703.1
MAGYLRLNHHSSGHFKQDSILSFGNTVLFRGTTIETTVTDKAATASDWAGEITALYGGSPAVVGLDVEWRPHHISYMSNKSATLQLCLNNKCLIMQLFYMDQIPQSIKDFLLNPNFTFVGIEVQDDVKKLREEYGLDCSRTMDVRAAAKARWPHRFRRPGLKDLARELCGLNMPKPKHVCMSNWEARVLSEAQVEYGCIDAFASYKIGHKLTLEI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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