当前解析结果
SmilChr08G002912| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002912 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002912 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002912 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 29089770 - 29091013 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998292 |
|---|---|
| GeneID | 130998292 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998292 |
| 原始查询 | LOC130998292 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=47.1; qcov=0.228; evalue=2.79e-18; confidence=weak |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998292 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779707.1 |
| 2 | Telomere | 端粒 | 0.40000 | XP_057779707.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057779707.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057779707.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779707.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:29089828 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B14,B35,B53 |
Chr8:29089845 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C9 |
Chr8:29089845 |
T |
TC |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr8:29089883 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B61,B8 |
Chr8:29089911 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A4 |
Chr8:29089950 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B79,C45 |
Chr8:29089961 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B95 |
Chr8:29089961 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr8:29089991 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C78 |
Chr8:29090019 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A8,B110,B115,B12,B129,B53,B77,B98,C22,C35,C42,C80,D2 |
Chr8:29090052 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
Chr8:29090134 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B13,B23,B34 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。