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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002915`

染色体: Chr08 坐标: 29127018-29130048 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002915`
名称	SmilChr08G002915
描述	uncharacterized SmilChr08G002915
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29127018 - 29130048 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998293`
GeneID	`130998293`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998293`
原始查询	`LOC130998293`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=39.3; qcov=0.916; evalue=3.68e-42; confidence=medium
Rice	`Os08g0106900` - identity=46.7; qcov=0.879; evalue=6.23e-61; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998293

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779708.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057779708.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779708.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779708.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29129173`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	31	A14,A22,A3,A4,A9,B104,B109,B11,B119,B134,B140,B21,B26,B3,B37,B44,B52,B69,B81,B86,B92,C17,C24,C29,C3,C31,C34,C41,C62,C84,D2
`Chr8:29129184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:29129193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B100,B109
`Chr8:29129194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C6,C63,C79
`Chr8:29129198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B68,C48,C8,D11
`Chr8:29129211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:29129227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B60
`Chr8:29129291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C28
`Chr8:29129296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D10
`Chr8:29129300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr8:29129301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B60,B79
`Chr8:29129302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779708.1

239 aa

120

239

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF01609 DDE_Tnp_1 64-222 aa PF13359 DDE_Tnp_4 71-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779708.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	64	222	3.6e-06	27.6	Transposase DDE domain
`XP_057779708.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	71	208	2.1e-21	76.9	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923725.1
GTTTGGTATTGGTTTATACCCTGTATAAGTTAATTTAATCTAGAACTATACTGTGTTTGGTATTCTGTTATACTTATGCGGATTTGCCATGGTTAATACCAAGGCCCGGTCTTATTTCTCCATATTAACCCCGCCTAATTATCCGACCTCCCCCCTCCGACAAATTTTACCTCGCCAATCTGTATTGATTTTTTGCTACCCTTATCACTATTTTCGAGGAAATTTTTTTTGCCCTAGTTTCTCACTGCCCCCAACATTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998293
ATGTTTCTTTCTGTCTTAGCCCACCATAAAAAAAACAGAGTTGTTCGGTTCGACTTTTGGAGATCTGGTCAAACAATATCGCACTACATACATGCCGTATTAGGAGCTATTATACGGATTCATGACTTGTTCCTAGCCAAACCCGAGCCCGTTCCCGCGGATTGCATTGATCCACGATGGCGATGGTTTAAGGGCTGTTTAGGAGCCTTAGACGGCACATACGTGAGTGTCATGGTTGGTAATGAAGACAAACCCCGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779708.1
MFLSVLAHHKKNRVVRFDFWRSGQTISHYIHAVLGAIIRIHDLFLAKPEPVPADCIDPRWRWFKGCLGALDGTYVSVMVGNEDKPRYRTRKGQISTNVLGVCDRNLNFSYVLSGWEGSAADSRILRDAISRPHGLKVPKGKYYLCDNGYANSDGFLTPYKGDRYHLKEWGPNNARPQNKEELFNLRHSKARNAIERAFGILKMRWNLHKLIVYKLQTIQTSIYHKVENSFIIMSSSRTT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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