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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002976`

染色体: Chr08 坐标: 29808636-29809801 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002976`
名称	SmilChr08G002976
描述	uncharacterized SmilChr08G002976
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29808636 - 29809801 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998299`
GeneID	`130998299`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998299`
原始查询	`LOC130998299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=21.9; qcov=0.848; evalue=1.3e-15; confidence=weak
Rice	`Os01g0930300` - identity=23.2; qcov=0.787; evalue=1.12e-08; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998299

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779714.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779714.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779714.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779714.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779714.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29808659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr8:29808679`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	7	B109,B24,B62,B80,C18,C31,C46
`Chr8:29808724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B41,B62,C84
`Chr8:29808773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B109,B2,B35
`Chr8:29808799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:29808813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B89,C87,D9
`Chr8:29808840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B14,B20,B94,C40,C82,C86
`Chr8:29808854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B68,B71
`Chr8:29808858`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C60
`Chr8:29808858`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C60
`Chr8:29808868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B75,B9,C64,C66
`Chr8:29808868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,B9,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779714.1

356 aa

178

356

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 59-141 aa PF13456 RVT_3 269-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779714.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	59	141	1.6e-19	71.0	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057779714.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	269	346	1.3e-10	41.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923731.1
ATGACACCCTATTTCTCTCAGAAGATTTCAGACTACTACTTTGATAATAAGTGGCACCTCACTTCTAGTTTTATGCAGTCTTTCCCGCGCATTTCTCTCGACATCATATCTACCCCCATTCCTGGATTGGCGGACGACAGATCCTGGATTCGCTCGGGTTTCGGGAACATTACTGCTGCTTCGGCCTTTGCTCACATACGACCTCAGTTCCCTAAGGTCGACTGGGGCTCCTGGATTTGGGCCCCTTTTATCCCCGCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998299
ATGACACCCTATTTCTCTCAGAAGATTTCAGACTACTACTTTGATAATAAGTGGCACCTCACTTCTAGTTTTATGCAGTCTTTCCCGCGCATTTCTCTCGACATCATATCTACCCCCATTCCTGGATTGGCGGACGACAGATCCTGGATTCGCTCGGGTTTCGGGAACATTACTGCTGCTTCGGCCTTTGCTCACATACGACCTCAGTTCCCTAAGGTCGACTGGGGCTCCTGGATTTGGGCCCCTTTTATCCCCGCTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779714.1
MTPYFSQKISDYYFDNKWHLTSSFMQSFPRISLDIISTPIPGLADDRSWIRSGFGNITAASAFAHIRPQFPKVDWGSWIWAPFIPARRSLFVWRTIVGKLPTFDMNRLIGIQGPNRCPLCSAAEETMDHVLLNCPFSASIWADVFRWFLIDQPLPLDVGSMIRFSIHQKNSKQVGNLWKAGVVSLLWSLWSHRNNVIHKNFAPSRHLILKQVRVFLCEAANNFVLGTMANSVSDLLILNNISIAGQPRKPFSYIYVAWHL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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