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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003039`

染色体: Chr08 坐标: 30558651-30559571 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003039`
名称	SmilChr08G003039
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30558651 - 30559571 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998308`
GeneID	`130998308`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998308`
原始查询	`LOC130998308`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=32; qcov=0.838; evalue=2.29e-28; confidence=low
Rice	`Os02g0202800` (OJ1135_F06.10-2) - identity=28.3; qcov=0.863; evalue=5.03e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998308

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779721.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779721.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779721.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779721.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779721.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30558852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B72
`Chr8:30558948`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A7,B104,B21,B41,C1,C55,C59,C81,D11
`Chr8:30559033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B28,C15,C79
`Chr8:30559054`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B4,C82
`Chr8:30559054`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B4,C82
`Chr8:30559074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C82
`Chr8:30559115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C82
`Chr8:30559118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C82
`Chr8:30559133`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B4,C82
`Chr8:30559133`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B4,C82
`Chr8:30559139`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B4,C82
`Chr8:30559139`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B4,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779721.1

291 aa

146

291

FAR1

PF03101 FAR1 60-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779721.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	60	154	4e-23	82.7	FAR1 DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923738.1
ATGCTTTGCTTCACTAATATTGTTTCATATCAAAGCCAACAACTATTACTTTTTTCAGATGCAGGGCATCACGAAGGCGAAGAAGTAGAATGTGATACCAATTCATACCTTCCCATTTGTGAAGCCAACAAGAAGCCGTACATAGGTCAACAATTCAAGACTATAAATGATGCATGGGAATTTTATAAAAAATATGGAGCAGCTTCAGGTTTTGGAACTCGGAAGAGCACGGCCAAAAAAGGAAAATATGGTCAAATATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998308
ATGCTTTGCTTCACTAATATTGTTTCATATCAAAGCCAACAACTATTACTTTTTTCAGATGCAGGGCATCACGAAGGCGAAGAAGTAGAATGTGATACCAATTCATACCTTCCCATTTGTGAAGCCAACAAGAAGCCGTACATAGGTCAACAATTCAAGACTATAAATGATGCATGGGAATTTTATAAAAAATATGGAGCAGCTTCAGGTTTTGGAACTCGGAAGAGCACGGCCAAAAAAGGAAAATATGGTCAAATATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779721.1
MLCFTNIVSYQSQQLLLFSDAGHHEGEEVECDTNSYLPICEANKKPYIGQQFKTINDAWEFYKKYGAASGFGTRKSTAKKGKYGQILYRYFICTREGAKPESQKEVPESSRRKTKKRRTPSTRNGCKATIKVNIQDDGKYVVTRFEESHNHELVSEECRPFMKQNRKIDQSHQMIMLKCAKANIGPVRAFRVFKELVGSYDDVGCTSKDFKNLNYDMNSHADGVDAQLLLDRFLSKRDCDDGFKCEYLTDEFDKVKSLFW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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