Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003074`

染色体: Chr08 坐标: 30936062-30937315 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003074`
名称	SmilChr08G003074
描述	uncharacterized SmilChr08G003074
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30936062 - 30937315 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998315`
GeneID	`130998315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998315`
原始查询	`LOC130998315`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998315

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779726.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779726.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057779726.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057779726.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057779726.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30936080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B63,C19,C55,C82
`Chr8:30936088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B20,B70
`Chr8:30936095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,C55,C82
`Chr8:30936100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,C55,C82
`Chr8:30936110`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	93	A1,A10,A11,A14,A20,A21,A3,A4,A5,B1,B10,B100,B106,B108,B109,B111,B114,B117,B120,B123,B127,B128,B129,B131,B133,B135,B136,B138,B14,B140,B15,B16,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B35,B41,B44,B47,B48,B50,B51,B53,B55,B6,B62,B68,B71,B76,B79,B80,B81,B84,B85,B87,B98,C1,C11,C13,C15,C17,C18,C20,C21,C24,C26,C31,C35,C37,C38,C39,C43,C47,C48,C51,C56,C6,C69,C77,C82,C9,D1,D10,D2,D4,D5,D6,D9
`Chr8:30936133`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C82
`Chr8:30936133`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C82
`Chr8:30936134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C28,C55
`Chr8:30936136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:30936140`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr8:30936140`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr8:30936151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923743.1
ATGGAGAGCGAGTGGAGAGAAGTGAAGAGGAGAGGGGTAGCGTCGACCTATTCCGAGAGACCACCGGTGAGGCAGCTAAATCATCCCAGCCATAGGTTCTACCCAAAACCTTACCATGTGAAAACTGATAAAAGGTATGGCGAAGCAGACGCATGGAACCGTGACTCACATCCTTGCATGCGGCACTTCCGACGAGAAGATAAAAATGAGGTGACCACTTACTTCTTCAATAACATCCCTGAAGATTGTAGTGTTGAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057779726.1_44286
ATGGAGAGCGAGTGGAGAGAAGTGAAGAGGAGAGGGGTAGCGTCGACCTATTCCGAGAGACCACCGGTGAGGCAGCTAAATCATCCCAGCCATAGGTTCTACCCAAAACCTTACCATGTGAAAACTGATAAAAGGTATGGCGAAGCAGACGCATGGAACCGTGACTCACATCCTTGCATGCGGCACTTCCGACGAGAAGATAAAAATGAGGTGACCACTTACTTCTTCAATAACATCCCTGAAGATTGTAGTGTTGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779726.1
MESEWREVKRRGVASTYSERPPVRQLNHPSHRFYPKPYHVKTDKRYGEADAWNRDSHPCMRHFRREDKNEVTTYFFNNIPEDCSVEFLKSKFGSVRKALDVFCPTKRDLKGKPFDFFRFEGVSDPEELLADLNQLWIGSYKIRVYKPRFNRASDVVWGGRTDKENDIPSANKMNVGISAGTRKAGVSFREALLGENEDRGENCGEDIFDEQLIFQPMVDEVEWLQDAFTGYLKTDFVWEEVKDEINCECAGRIKVTTLGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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