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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003089`

染色体: Chr08 坐标: 31108817-31109911 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003089`
名称	SmilChr08G003089
描述	uncharacterized SmilChr08G003089
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31108817 - 31109911 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998318`
GeneID	`130998318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998318`
原始查询	`LOC130998318`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0225900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0225900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41220` (GSTT3) glutathione S-transferase THETA 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834124] identity=29.5; qcov=0.569; evalue=4.91e-10; confidence=low
Rice	`Os08g0225900` - identity=28.8; qcov=1.02; evalue=9.23e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779729.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779729.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779729.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779729.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31108832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr8:31108843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C63
`Chr8:31108852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:31108862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr8:31108896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:31108901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	79	A10,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A25,A5,A6,A9,B101,B103,B108,B109,B111,B115,B118,B121,B127,B132,B137,B139,B18,B20,B24,B25,B28,B34,B36,B37,B44,B48,B49,B54,B56,B57,B64,B65,B67,B68,B7,B72,B73,B74,B77,B79,B80,B83,B84,B85,B86,B91,B96,C10,C18,C19,C24,C33,C4,C42,C43,C44,C45,C49,C51,C54,C6,C63,C65,C67,C73,C76,C79,C8,C84,D9
`Chr8:31108926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr8:31108934`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B135
`Chr8:31108934`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B135
`Chr8:31108940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B99
`Chr8:31108956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:31109021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779729.1

364 aa

182

364

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 214-350 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779729.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	214	350	3.5e-07	31.9	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923746.1
ATGTCTAATCCTCAAGTATATCCCAACAATCCCATGAGTCAATCAGCCCATTCATTTCAATTTTCATCCCAAGGGCATCCATCTCAGGGATTTCAGCCATACGAAATTCCCTTTCAATGGTATCCCCCTCCAGGATTTTCCCCACAAGGATATCCTTCACAGAGGTTTATATTTTCTGACTCCTCTAGGAGGACCAGTGTAGATGAGAGTGGTACTGATGGAGGCACAACATCTTCAGGAAGGACAGTTCAAGGTTTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998318
ATGTCTAATCCTCAAGTATATCCCAACAATCCCATGAGTCAATCAGCCCATTCATTTCAATTTTCATCCCAAGGGCATCCATCTCAGGGATTTCAGCCATACGAAATTCCCTTTCAATGGTATCCCCCTCCAGGATTTTCCCCACAAGGATATCCTTCACAGAGGTTTATATTTTCTGACTCCTCTAGGAGGACCAGTGTAGATGAGAGTGGTACTGATGGAGGCACAACATCTTCAGGAAGGACAGTTCAAGGTTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779729.1
MSNPQVYPNNPMSQSAHSFQFSSQGHPSQGFQPYEIPFQWYPPPGFSPQGYPSQRFIFSDSSRRTSVDESGTDGGTTSSGRTVQGLENINLSVESSSDDDEENTNMRRVFYSDAECEVLAQCYIDISIDSVVENEQKMDKMLKRIVKAYNENRPANTPSRKFKQLKANFYKMQKQVKLFSKCSNRIASIWKSGANDADIMEMAQTEYKEHHGTKSFKYVGVWRILKEVSKFTEVEGNVQASKRIKNIEGRAYTSSSTAEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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