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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003121`

染色体: Chr08 坐标: 31506145-31507974 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003121`
名称	SmilChr08G003121
描述	uncharacterized SmilChr08G003121
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31506145 - 31507974 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998324`
GeneID	`130998324`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998324`
原始查询	`LOC130998324`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0278500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0278500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0278500` - identity=22.9; qcov=0.194; evalue=5.29e-06; confidence=weak
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998324

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779734.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779734.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057779734.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779734.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31506174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B75
`Chr8:31506174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:31506193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:31506226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr8:31506243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:31506258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B118,B71,B89
`Chr8:31506320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B27,B69,D1,D2
`Chr8:31506387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C82
`Chr8:31506430`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C87
`Chr8:31506430`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C87
`Chr8:31506621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:31506630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779734.1

609 aa

304

609

RRM_1

PF00076 RRM_1 56-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779734.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	56	121	8.1e-06	26.3	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923751.1
ATGGAGCCTAGAGAGACCGAGAGAGAGTGGAGAGTGGTGAGAAGAAGAGGGATTGGTCCAAAACATGTCGAGAGAAAACAGGCAAGAAGTTGGAATCGGAGCAGTTTGAATGGGAGGAGAGATTGGAGTTCGAATGAACGCGATGACACTACAACCTTTTTCTTTAACAACATCCCAGAGGATTGCAGCCTTGATTTTCTCAGACGTAAGTTTGAGACGGTTGCGAAGACGGTGGATGTATACTGCCCAAGGAAGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998324
ATGGAGCCTAGAGAGACCGAGAGAGAGTGGAGAGTGGTGAGAAGAAGAGGGATTGGTCCAAAACATGTCGAGAGAAAACAGGCAAGAAGTTGGAATCGGAGCAGTTTGAATGGGAGGAGAGATTGGAGTTCGAATGAACGCGATGACACTACAACCTTTTTCTTTAACAACATCCCAGAGGATTGCAGCCTTGATTTTCTCAGACGTAAGTTTGAGACGGTTGCGAAGACGGTGGATGTATACTGCCCAAGGAAGAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779734.1
MEPRETEREWRVVRRRGIGPKHVERKQARSWNRSSLNGRRDWSSNERDDTTTFFFNNIPEDCSLDFLRRKFETVAKTVDVYCPRKRDLWGRPFGFVRFERVERSETLLVDLNKLWIGSYKVRVYKPKFQRDYKPKFERVDEKRRNEQNSVKEKKLEQIQPCNMKVYNRHAGVSFKEALTGAKDDKELDDETLQFQTTEEDLVWLNGAFTGYIKSEFLWEEVREEINSECAGCFKLNSLGGNMVLIQSSNEQTTKENLNKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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