当前解析结果
SmilChr08G003242| 统一基因 ID | SmilChr08G003242 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003242 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003242 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 33312925 - 33313871 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998355 |
|---|---|
| GeneID | 130998355 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130998355 |
| 原始查询 | LOC130998355 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak |
| 产物 | aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak |
| 拟南芥 | AT2G06105 (AT2G06105)aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=37.68; qcov=0.235; evalue=6.86e-07; confidence=weak |
| 水稻 | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998355 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞质 | 1.00000 | XP_057779763.1 |
| 2 | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057779763.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:33312945 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A18,B51,C1,C45,C72,C78 |
Chr8:33312965 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B47,C24,C52 |
Chr8:33312970 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B134,B20 |
Chr8:33312973 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B26 |
Chr8:33312973 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr8:33312984 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A3,C31,C74 |
Chr8:33312984 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | A3,C31,C74 |
Chr8:33312990 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B135 |
Chr8:33313008 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B26,B59,C55,D10 |
Chr8:33313035 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,C35,C4,D11 |
Chr8:33313055 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B76 |
Chr8:33313055 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B76 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。