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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003297`

染色体: Chr08 坐标: 34084820-34086727 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003297`
名称	SmilChr08G003297
描述	uncharacterized SmilChr08G003297
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34084820 - 34086727 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998375`
GeneID	`130998375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998375`
原始查询	`LOC130998375`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OJ1756_G07.6; symbol=OJ1756_G07.6; hit=Os08g0392500; species=rice; confidence=low
产物	OJ1756_G07.6; symbol=OJ1756_G07.6; hit=Os08g0392500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0392500` (OJ1756_G07.6) - identity=27.2; qcov=0.378; evalue=4.44e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779778.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779778.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779778.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779778.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779778.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34084864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B101,B9
`Chr8:34084873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:34084938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B28,B7,B80,C62
`Chr8:34084949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B46
`Chr8:34084949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:34084978`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B140,C82
`Chr8:34084978`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:34084983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr8:34085000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:34085032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B51,C35
`Chr8:34085040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B8,C3,C7
`Chr8:34085050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779778.1

429 aa

214

429

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 202-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779778.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	202	329	3.1e-12	47.6	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923795.1
ATGTATTTGTTTGTTTGGTTGATGGATAGTGGAGGTTATGCTGTCGAAATTTCGTTAGATTCAAGTAACATGTCTCAGCGTAGAAGTTTATTTTCGTTTGGTCGATTTGGTCGGTCTGATCGGGATGAGCAGCCGACTGATGACACATCTGATGGGTCCGGTACAGGGATTTCTGCGACTCCTGAGACTCCCCAGGCCTCTAGTAGTTCACGGGCTAGACGGCCCAGAGGCCCTACAGCTGCCGCCATCACCATCAGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998375
ATGTATTTGTTTGTTTGGTTGATGGATAGTGGAGGTTATGCTGTCGAAATTTCGTTAGATTCAAGTAACATGTCTCAGCGTAGAAGTTTATTTTCGTTTGGTCGATTTGGTCGGTCTGATCGGGATGAGCAGCCGACTGATGACACATCTGATGGGTCCGGTACAGGGATTTCTGCGACTCCTGAGACTCCCCAGGCCTCTAGTAGTTCACGGGCTAGACGGCCCAGAGGCCCTACAGCTGCCGCCATCACCATCAGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779778.1
MYLFVWLMDSGGYAVEISLDSSNMSQRRSLFSFGRFGRSDRDEQPTDDTSDGSGTGISATPETPQASSSSRARRPRGPTAAAITIRDSSTKKAHGRIVFQRMPNGALMEPVGLAKACTKAFKRVDNPGGYTWRLTPPAVKDSYYAELQKEFAWSPEDELLVMAMWEQKASKRYSDMMSDYKRKLKASTDKGREMDRPLWMSAEFWTGLQAYWSQEAVQAVSQRARANRMSEPDGPGTGISRHVGGSQSTRILQQSLSLET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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