当前解析结果
SmilChr08G003303| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003303 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003303 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003303 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 34194115 - 34195707 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998377 |
|---|---|
| GeneID | 130998377 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998377 |
| 原始查询 | LOC130998377 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0107400; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0107400; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0107400- identity=31.3; qcov=0.621; evalue=1.16e-25; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998377 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.40000 | XP_057779780.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057779780.1 |
| 3 | Trans-golgi network | Trans-golgi network | 0.40000 | XP_057779780.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057779780.1 |
| 5 | Centrosome | 中心体 | 0.20000 | XP_057779780.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:34194149 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B38,B39 |
Chr8:34194149 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B38,B39 |
Chr8:34194169 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr8:34194240 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:34194287 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A24 |
Chr8:34194315 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A25 |
Chr8:34194414 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A10,A11,A3,B10 |
Chr8:34194471 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr8:34194675 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr8:34194794 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr8:34194812 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B41,B62,C31,C41 |
Chr8:34194937 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B118,B91,C53,C84 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。