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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003348`

染色体: Chr08 坐标: 34868555-34869785 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003348`
名称	SmilChr08G003348
描述	uncharacterized SmilChr08G003348
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34868555 - 34869785 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998388`
GeneID	`130998388`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998388`
原始查询	`LOC130998388`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=31.6; qcov=0.456; evalue=3.36e-19; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=40.7; qcov=0.435; evalue=1.11e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998388

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779790.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779790.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779790.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779790.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779790.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34868578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,C13,C36,C46
`Chr8:34868591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B133
`Chr8:34868628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:34868682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B111,B30
`Chr8:34868688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A2,B107,B11,B119,B124,B135,B28,B37,B45,B47,B52,B54,B69,B88,B95,B99,C23,C33,C4,C41,C45,C5,C54,C60,C68,C71,C8
`Chr8:34868695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B107,B17,C13,C24
`Chr8:34868700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B121,B24,B96
`Chr8:34868700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B24,B96
`Chr8:34868701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A2,B10,B125,B48,B51,B58,B98,C17,C33,C76,D10
`Chr8:34868744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B47,C13,C18
`Chr8:34868747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:34868753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779790.1

333 aa

166

333

RVT_1

PF00078 RVT_1 81-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779790.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	81	152	3.8e-12	47.2	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923807.1
ATGAGGAGGAAAATTTCAAATGACGAGAGGCATTGGCTGATCAGGGATTTTGATCTGGACGAGATTAAAGAAGCAGTTTGGAGTTGTTGTGGACACAAGAGTCCGGGACCCGATGGATTTAACTTCACATTCTGGAGAGCGGCGTGGCACGTGGTTAAAGAGGACTTACTCCAGGTTTTGAAGGAATTTCACGAAAACGGGAAAATACCGAAAGGTGGTAACGCCTCTTTTATTGTTCTGATTCCGAAGAAAGAAGGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998388
ATGAGGAGGAAAATTTCAAATGACGAGAGGCATTGGCTGATCAGGGATTTTGATCTGGACGAGATTAAAGAAGCAGTTTGGAGTTGTTGTGGACACAAGAGTCCGGGACCCGATGGATTTAACTTCACATTCTGGAGAGCGGCGTGGCACGTGGTTAAAGAGGACTTACTCCAGGTTTTGAAGGAATTTCACGAAAACGGGAAAATACCGAAAGGTGGTAACGCCTCTTTTATTGTTCTGATTCCGAAGAAAGAAGGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779790.1
MRRKISNDERHWLIRDFDLDEIKEAVWSCCGHKSPGPDGFNFTFWRAAWHVVKEDLLQVLKEFHENGKIPKGGNASFIVLIPKKEGAGSLDDFRPISLITSLFKIVAKILAERLKRVMGSIISDNQSAFVKGRFILDGVVILNEAISEAKKKRVGRLNEFIERAAERQFLVPANIGKDKVPISHLQYADDTIFLLEVDDRNMESVKKLLILFQFVSGLAVNFDKSCLLTVGVDEAVERRWASLLMCKIGSFPCNYLGTKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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