当前解析结果
SmilChr08G003367| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003367 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003367 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003367 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 35288216 - 35290779 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998389 |
|---|---|
| GeneID | 130998389 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998389 |
| 原始查询 | LOC130998389 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998389 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779791.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057779791.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057779791.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057779791.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057779791.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:35288257 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,C67 |
Chr8:35288291 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr8:35288312 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 147 | A10,A13,A14,A15,A2,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A6,A7,B10,B101,B102,B105,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B115,B12,B120,B122,B123,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B134,B135,B136,B14,B17,B18,B19,B2,B23,B24,B26,B27,B31,B34,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B47,B48,B5,B51,B52,B54,B55,B56,B60,B61,B62,B64,B66,B69,B7,B70,B71,B76,B81,B83,B84,B87,B89,B91,B92,B94,B96,B97,B98,B99,C11,C12,C14,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C25,C27,C30,C31,C32,C33,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C55,C56,C58,C61,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C84,D1,D3,D4,D5,D7 |
Chr8:35288321 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B128,B136,B22 |
Chr8:35288328 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B56,B84,B96,C5 |
Chr8:35288335 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B103,B57,D4 |
Chr8:35288341 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B33,B49,C32,C68 |
Chr8:35288348 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A20,B118,B91,C53,C81 |
Chr8:35288363 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B115,B36,B57,B76,C10 |
Chr8:35288371 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,A18,B100,B72,C58 |
Chr8:35288374 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B133,C57 |
Chr8:35288392 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B48,B73,B89 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。