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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003973`

染色体: Chr01 坐标: 58164188-58166715 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003973`
名称	SmilChr01G003973
描述	subtilisin-like protease SBT3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58164188 - 58166715 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998396`
GeneID	`130998396`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998396`
原始查询	`LOC130998396`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT3
产物	subtilisin-like protease SBT3
Arabidopsis	`AT5G67090` (AT5G67090) Subtilisin-like serine endopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836844] identity=40.5; qcov=1.02; evalue=7.38e-177; confidence=medium
Rice	`Os05g0435800` (OsSub47) - identity=45.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998396

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057779799.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057779799.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779799.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779799.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779799.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58164584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C46
`Chr1:58164642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,A5
`Chr1:58164760`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B100,B46,B56,B68,B96,C2
`Chr1:58164822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B82,C20,D4
`Chr1:58164834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B24
`Chr1:58164925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:58164970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:58165052`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr1:58165052`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr1:58165055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B15
`Chr1:58165144`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr1:58165144`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779799.1

757 aa

378

757

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 27-108 aa PF00082 Peptidase_S8 133-576 aa PF17766 fn3_6 648-750 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779799.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	27	108	2.3e-17	64.2	Peptidase inhibitor I9
`XP_057779799.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	133	576	5.5e-42	144.8	Subtilase family
`XP_057779799.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	648	750	1.6e-24	86.6	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923816.1
TAAGATATTTCCTTTAGTGAAGCTGAAATCCTTGATGCGGCATAGCCTGCACTAGAGCAGATTAGCATCTATATAACCTATTAATCTATTTTAAACGTTAGATCAGCAAAAATGCAGCCTCCTTATTCAATTTATCTGATTCTCTTCTCATTTTTTCTTTGGGCAAATGATGCTTCATCCAAAAGATCCACATACATCGTCCACATGGACAAATCCTCCATGCCTAAAGCATTTTCCAGTCACCATTATTGGTACTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998396
ATGCAGCCTCCTTATTCAATTTATCTGATTCTCTTCTCATTTTTTCTTTGGGCAAATGATGCTTCATCCAAAAGATCCACATACATCGTCCACATGGACAAATCCTCCATGCCTAAAGCATTTTCCAGTCACCATTATTGGTACTCTTCCCTTCTCAAATCAACAGCTCCGGCACCACTAGGCGCCGACAAACCCGAGGTGAAGTTTATCTACACCTACGACCATGCCTTCCATGGATTCAGTGCAGTGCTGTCCGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779799.1
MQPPYSIYLILFSFFLWANDASSKRSTYIVHMDKSSMPKAFSSHHYWYSSLLKSTAPAPLGADKPEVKFIYTYDHAFHGFSAVLSGDEVEALKKSVGFISAYTDSIVTPDTTHSSKFLGLNTAAGLWPASNYGKDVIIGVIDSGIWPESPSFKDDGMTEIPSRWKGVCDGGEDFNSSLCNKKIIGVRYFNQGYRASDPDRELKNSARDDEGHGSHVSSTAAGNFVEGVSFFGYAPGTARGMAPRARLAVYKVLWGGAVSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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