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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003975`

染色体: Chr01 坐标: 58181847-58184394 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003975`
名称	SmilChr01G003975
描述	subtilisin-like protease SBT3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58181847 - 58184394 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998402`
GeneID	`130998402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998402`
原始查询	`LOC130998402`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT3
产物	subtilisin-like protease SBT3
Arabidopsis	`AT5G67360` (ARA12) Subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836871] identity=39.6; qcov=1.02; evalue=6.5e-168; confidence=medium
Rice	`Os05g0435800` (OsSub47) - identity=44.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057779805.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057779805.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779805.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779805.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779805.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58182037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:58182059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:58182185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:58182243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B19,C61,C78
`Chr1:58182615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr1:58182655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B123
`Chr1:58182839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B25,B88,C25
`Chr1:58182994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C26
`Chr1:58183221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B76,C53,C84
`Chr1:58183266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:58183310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr1:58183352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779805.1

760 aa

380

760

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 27-109 aa PF00082 Peptidase_S8 134-578 aa PF17766 fn3_6 649-752 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779805.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	27	109	1.5e-17	64.7	Peptidase inhibitor I9
`XP_057779805.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	134	578	6.1e-44	151.2	Subtilase family
`XP_057779805.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	649	752	1.1e-24	87.2	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923822.1
TTGTCCCAAAAAAACAAAAGAAAGTAATAGTCTAGATAAGGTATTGCAACTAGGCAAGCTGAAATCCTTGATGAGGCGTAAGCTATTAGCATCTATATAACCTTGTATTAGTATATGTTTTAGAACAGCAAAAATGAAGCTTCCTATTTCAGTTTCTCTTATTCTCTTCACATTTCTTCTTTGGTCTGATCATGCTTCATCGAAAAGATCCACTTACATTGTCCACATGGACAAGTCCTGCATGCCCAAAGCATTTTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998402
ATGAAGCTTCCTATTTCAGTTTCTCTTATTCTCTTCACATTTCTTCTTTGGTCTGATCATGCTTCATCGAAAAGATCCACTTACATTGTCCACATGGACAAGTCCTGCATGCCCAAAGCATTTTCCAGTCACCATTATTGGTATGCTTCCCTTCTTAAATCTACCAAATCTGCATGGCTTGATGACGCTGATATACCCAAGTCGAAACTTATCTACACCTACAACCATGCCTTCCATGGATTCAGCGCATTGCTGTCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779805.1
MKLPISVSLILFTFLLWSDHASSKRSTYIVHMDKSCMPKAFSSHHYWYASLLKSTKSAWLDDADIPKSKLIYTYNHAFHGFSALLSGDEVEALKKSAGFISAYKDDIVTPDTTHSSNFLGLTGAAGLWPASNYGKDVIIGVVDSGIWPESPSFRDDGMTEIPASWKGICDGGEDFNSSLCNRKIIGARYFNKGYEAENAGRTRNSARDDDGHGTHVASIAAGNIVDGVSFFGYAPGTARGVAPRARLAVYKVLWGGGVSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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