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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003415`

染色体: Chr08 坐标: 36296249-36296935 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003415`
名称	SmilChr08G003415
描述	uncharacterized SmilChr08G003415
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	36296249 - 36296935 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998407`
GeneID	`130998407`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998407`
原始查询	`LOC130998407`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998407

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779807.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779807.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057779807.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779807.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779807.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:36296248`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr8:36296251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr8:36296252`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	135	A1,A10,A11,A13,A18,A2,A21,A22,A23,A3,A4,A6,A7,B100,B104,B108,B111,B112,B117,B119,B120,B124,B125,B127,B129,B130,B138,B14,B15,B16,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B25,B27,B28,B3,B32,B33,B34,B38,B39,B4,B40,B42,B44,B45,B46,B47,B5,B50,B52,B55,B56,B57,B6,B60,B61,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B72,B75,B77,B82,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B94,B96,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C15,C19,C21,C22,C26,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C38,C39,C4,C41,C45,C46,C48,C49,C5,C51,C56,C57,C58,C59,C6,C62,C64,C67,C69,C70,C75,C76,C79,C80,C82,C84,C85,C86,C87,D2,D3,D4,D9
`Chr8:36296279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr8:36296282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:36296283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr8:36296312`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	54	A1,A14,A2,B107,B11,B117,B138,B16,B21,B23,B26,B27,B28,B31,B32,B33,B45,B46,B47,B51,B53,B57,B59,B60,B65,B7,B70,B78,B83,B85,B87,B89,B91,B97,B99,C13,C17,C25,C27,C29,C33,C34,C36,C39,C42,C46,C56,C6,C63,C65,C67,C78,C8,C83
`Chr8:36296341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B56,B68,B96,C81
`Chr8:36296342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B50,B8,C3
`Chr8:36296344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr8:36296368`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	228	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C46,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C70,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr8:36296400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779807.1

228 aa

114

228

RVT_3

PF13456 RVT_3 124-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779807.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	124	227	7.1e-15	55.7	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923824.1
ATGTCGTCGGTGTGGTTTGACAATGGAGACGCCGGAACATGCACTCAGAGATTGCGTTTGGGTCTCTCCCACTCTGGGAAATGTCCCCTTTGCGCCTCCAACCTTTGGCAAGTAATGATATCCCCCATCACTACTTGGTTCGATCGCATTCGACAGAATCCGGTTAAGGAGGTTCATTCTCTGTTTGCGTCGATTGCCTGGGCTTGCTGGTACTCGCAGAATCTCCTTATCTTCCAAGACAAATCTCTCTCTCATGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998407
ATGTCGTCGGTGTGGTTTGACAATGGAGACGCCGGAACATGCACTCAGAGATTGCGTTTGGGTCTCTCCCACTCTGGGAAATGTCCCCTTTGCGCCTCCAACCTTTGGCAAGTAATGATATCCCCCATCACTACTTGGTTCGATCGCATTCGACAGAATCCGGTTAAGGAGGTTCATTCTCTGTTTGCGTCGATTGCCTGGGCTTGCTGGTACTCGCAGAATCTCCTTATCTTCCAAGACAAATCTCTCTCTCATGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779807.1
MSSVWFDNGDAGTCTQRLRLGLSHSGKCPLCASNLWQVMISPITTWFDRIRQNPVKEVHSLFASIAWACWYSQNLLIFQDKSLSHVDCLAIAHRAACSKSLPDHLPLTRNLTLNCSRDSQLKINCDAAIDVGRGLGFGVVSMNKDGMLVVGRQAFIPGFYSAEEGEARAILEGLIMCKDKGFEDIIIETNCQSLFWRFQNRKEDRSYLGDTVDKILRLATSFGCCSFS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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