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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003450`

染色体: Chr08 坐标: 36974263-36976436 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003450`
名称	SmilChr08G003450
描述	uncharacterized SmilChr08G003450
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	36974263 - 36976436 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998416`
GeneID	`130998416`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998416`
原始查询	`LOC130998416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20167 (Retrotransp-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998416

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779815.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057779815.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779815.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779815.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779815.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:36974268`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B1,B121
`Chr8:36974268`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B1,B121
`Chr8:36974275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B121,D8
`Chr8:36974337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B73,D3
`Chr8:36974349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C9,D1,D3
`Chr8:36974355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:36974357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B83
`Chr8:36974361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B127,B28,C47,C57
`Chr8:36974367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B83,C60
`Chr8:36974379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C57
`Chr8:36974402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B25,B98,C55
`Chr8:36974403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779815.1

708 aa

354

708

Retrotransp-rel

PF20167 Retrotransp-rel 376-537 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779815.1`	Pfam	`PF20167`	Retrotransp-rel	Domain	376	537	8.1e-25	88.4	Putative plant retrotransposon-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923832.1
ATGGACAAAAATCCTGATCTTTCCTCTCTCATCAAGAGTCTGATCCAACACTTTGGATCACCGGAAAGTGCAGCCAAACATCTCTCCGCCCTCCCTCAGATGGCCGAATCAACCGACAAACCCTCATCTTCTCAAACTCCGGTGGAAGTCCCAGGAGGAATTTTTCCTCCAGCTCCTTCTCCAAAGGGCTCTCCGAAGAGAAGTACCACTGAATCGTCTGTGGGAGCTGATGTTGATCCCGTCTCCTTGCAAATGATAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998416
ATGGACAAAAATCCTGATCTTTCCTCTCTCATCAAGAGTCTGATCCAACACTTTGGATCACCGGAAAGTGCAGCCAAACATCTCTCCGCCCTCCCTCAGATGGCCGAATCAACCGACAAACCCTCATCTTCTCAAACTCCGGTGGAAGTCCCAGGAGGAATTTTTCCTCCAGCTCCTTCTCCAAAGGGCTCTCCGAAGAGAAGTACCACTGAATCGTCTGTGGGAGCTGATGTTGATCCCGTCTCCTTGCAAATGATAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779815.1
MDKNPDLSSLIKSLIQHFGSPESAAKHLSALPQMAESTDKPSSSQTPVEVPGGIFPPAPSPKGSPKRSTTESSVGADVDPVSLQMIETPINPEPISTVPPLESVHSKMAHGSSAKGVENLTKGKTSVHATSKKSTEHPAFGVTQHQTPLPTPSEESIPSSKEESAHASQDTSMERIGEIAKEALLDLASQPGSDVDKASIVAEEECAAGDIPTSMDVDDSEKIPDVGQDVDPEESTDVIDVDTFVPDKKSRKRKAGVVSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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