当前解析结果
SmilChr08G003460| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003460 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003460 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003460 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 37176669 - 37177346 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998421 |
|---|---|
| GeneID | 130998421 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998421 |
| 原始查询 | LOC130998421 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998421 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057779819.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057779819.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057779819.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779819.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779819.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:37176695 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B6,C15,C58 |
Chr8:37176757 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr8:37176780 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A13,A22,B40,B58,B64,C84,D2 |
Chr8:37176781 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 27 | A14,B105,B109,B114,B121,B133,B23,B24,B3,B51,B61,B65,B70,B92,B94,C11,C14,C17,C3,C34,C44,C51,C58,C64,C81,D7,D9 |
Chr8:37176800 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 30 | A14,B105,B109,B114,B121,B133,B134,B23,B24,B3,B34,B51,B61,B65,B69,B70,B89,B92,C11,C14,C17,C3,C34,C44,C51,C58,C64,C81,D7,D9 |
Chr8:37176804 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr8:37176806 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A5,B35,B74,C31 |
Chr8:37176809 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B15,D9 |
Chr8:37176814 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,B2,C6 |
Chr8:37176831 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B88,C12,C25 |
Chr8:37176832 |
CCA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B103,B118,B22,B56,B64,C37 |
Chr8:37176836 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 7 | B103,B118,B22,B56,B64,B96,C37 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。