当前解析结果
SmilChr08G003483| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003483 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003483 |
| 描述 | protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 37487553 - 37488491 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998427 |
|---|---|
| GeneID | 130998427 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998427 |
| 原始查询 | LOC130998427 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like |
| 产物 | protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like |
| Arabidopsis | AT4G38180 (FRS5)FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=34.1; qcov=0.545; evalue=4.22e-20; confidence=low |
| Rice | Os12g0225300- identity=29.3; qcov=0.526; evalue=1.45e-14; confidence=low |
| GO | GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04434 (SWIM) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998427 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779825.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057779825.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779825.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779825.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779825.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057779825.1PF04434
SWIM 120-142 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057779825.1 |
Pfam | PF04434 |
SWIM | Domain | 120 | 142 | 2.6e-07 | 30.7 | SWIM zinc finger |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。