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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003496`

染色体: Chr08 坐标: 37547147-37547725 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003496`
名称	SmilChr08G003496
描述	uncharacterized SmilChr08G003496
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37547147 - 37547725 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998432`
GeneID	`130998432`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998432`
原始查询	`LOC130998432`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01120; symbol=AT5G01120; hit=AT5G01120; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01120; symbol=AT5G01120; hit=AT5G01120; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01120` (AT5G01120) - identity=34.7; qcov=1; evalue=2.25e-26; confidence=low
Rice	`Os04g0594700` - identity=33.3; qcov=0.969; evalue=3.17e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998432

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779830.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779830.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779830.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779830.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779830.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37547251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B57,B58,C63,D7
`Chr8:37547274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B57,B58,C63,D7
`Chr8:37547294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B103,B132
`Chr8:37547296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B57,B58,C63,D7
`Chr8:37547342`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C8,D4
`Chr8:37547342`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C8,D4
`Chr8:37547343`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A14,A15,B102,B113,B118,B123,B131,B136,B140,B16,B18,B29,B53,B67,B9,C20,C45,C5,C53,C55,C60,C71,C84,C85
`Chr8:37547346`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A16,A4,A7,B100,B115,B12,B124,B125,B137,B139,B14,B28,B30,B42,B49,B51,B52,B55,B65,B7,B73,B81,B90,B92,C12,C18,C27,C29,C32,C33,C39,C40,C41,C46,C49,C6,C73,C79,C81,D11,D4,D5,D9
`Chr8:37547349`	`TG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B126,C63
`Chr8:37547555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr8:37547561`	`A`	`AC`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	C2
`Chr8:37547561`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779830.1

192 aa

192

DUF674

PF05056 DUF674 8-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779830.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	8	191	2.5e-46	159.2	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923847.1
ATGTCTGATGCTAAAAAGGGTGCTACATTGTCGTTGAAAGTGATGATCAATAAAGAGAGAACCAAGGTATTCTTCGCAGAAGCTGACAGCCATTTTGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGAGTTTGCCGTTGGGAAGAATTATCAAAGTCCTCAACAACCACTATGGAGACGAGGCAGAGGCAGCCACCATTGGAAGCTTATGCAGTTTGTACCGTAGCGTAGTAAATCTCGATAGTGTCCATTTCTGGACAGATGGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998432
ATGTCTGATGCTAAAAAGGGTGCTACATTGTCGTTGAAAGTGATGATCAATAAAGAGAGAACCAAGGTATTCTTCGCAGAAGCTGACAGCCATTTTGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGAGTTTGCCGTTGGGAAGAATTATCAAAGTCCTCAACAACCACTATGGAGACGAGGCAGAGGCAGCCACCATTGGAAGCTTATGCAGTTTGTACCGTAGCGTAGTAAATCTCGATAGTGTCCATTTCTGGACAGATGGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779830.1
MSDAKKGATLSLKVMINKERTKVFFAEADSHFADILLSFLSLPLGRIIKVLNNHYGDEAEAATIGSLCSLYRSVVNLDSVHFWTDGAKQTLLDPTSSSEDEYERLKLDITDFQPAKYFYCDKYSYHTYSQSYRYRSVSIYYDHVKKCKFCSSNGTMKIEVVKKGSEAAASRDGVFTMNTSSFIISDDLHISK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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