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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003497`

染色体: Chr08 坐标: 37549233-37550802 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003497`
名称	SmilChr08G003497
描述	uncharacterized SmilChr08G003497
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37549233 - 37550802 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998433`
GeneID	`130998433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998433`
原始查询	`LOC130998433`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=30.4; qcov=0.749; evalue=1.01e-29; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=32.2; qcov=0.706; evalue=1.76e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779831.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779831.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779831.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779831.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779831.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37549430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B140,B58,C43,C73
`Chr8:37550288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B92
`Chr8:37550290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B99,C62
`Chr8:37550405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B140,C60
`Chr8:37550426`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B106,B140,C60
`Chr8:37550426`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B106,B140,C60
`Chr8:37550430`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B126,B127,B8,B90,C43
`Chr8:37550430`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B126,B127,B8,B90,C43
`Chr8:37550431`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B119,B123,B28,B7,C49,C55
`Chr8:37550432`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B106,B126,B127,B140,B8,B90,C43,C60
`Chr8:37550445`	`TAC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B119,B28,B7,C49
`Chr8:37550498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B7,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779831.1

303 aa

152

303

DUF674

PF05056 DUF674 8-219 aa PF05056 DUF674 219-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779831.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	8	219	5.1e-63	214.2	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057779831.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	219	297	5.1e-63	214.2	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923848.1
ATGGCTGATGACAAAAAGGGTGCTACATTTTCGTTGAAAGTGATGATCAATAAAGAGAGAACTAAGGTATTCTTTGCAGACTCCGACAGCCACTTCGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGAGTTTGCCGTTGGGAAGAATTGTCAAAGTCCTCGAGAAGCACTTTGGAGACGAGCCGCCTACCATTGGTAGCTTAAGCAGTTTATACCGTAGCTTAGTAAATCTCGACAGTTCCTATTTCTGGACAAACGGGGCTAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998433
ATGGCTGATGACAAAAAGGGTGCTACATTTTCGTTGAAAGTGATGATCAATAAAGAGAGAACTAAGGTATTCTTTGCAGACTCCGACAGCCACTTCGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGAGTTTGCCGTTGGGAAGAATTGTCAAAGTCCTCGAGAAGCACTTTGGAGACGAGCCGCCTACCATTGGTAGCTTAAGCAGTTTATACCGTAGCTTAGTAAATCTCGACAGTTCCTATTTCTGGACAAACGGGGCTAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779831.1
MADDKKGATFSLKVMINKERTKVFFADSDSHFADILLSFLSLPLGRIVKVLEKHFGDEPPTIGSLSSLYRSLVNLDSSYFWTNGAKQTLLNPASSSEAEYQRLKLDITDFQPAEYFKCSKYPIHHSQSYRFRSVSIYYDDVSMCKLCLQDSMIKEVVKKGSEAAASREGVFTMNTSSFLISDDLHIFPSETGLLEIISFLGITDMDNAEQIKVDLGFNEGSYLKGSPTYHVADDLTVTPFCFASTLSSLKEQKISISDVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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