当前解析结果
SmilChr08G003585| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003585 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003585 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003585 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 38631624 - 38632151 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998456 |
|---|---|
| GeneID | 130998456 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998456 |
| 原始查询 | LOC130998456 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993]; symbol=AT5G28780; hit=AT5G28780; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993]; symbol=AT5G28780; hit=AT5G28780; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G28780 (AT5G28780)PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993] identity=37.2; qcov=0.891; evalue=3.34e-30; confidence=medium |
| Rice | Os07g0255200- identity=32.2; qcov=0.834; evalue=6.77e-21; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF21530 (Pif1_2B_dom) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998456 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779856.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057779856.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779856.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779856.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779856.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057779856.1PF21530
Pif1_2B_dom 102-147 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057779856.1 |
Pfam | PF21530 |
Pif1_2B_dom | Domain | 102 | 147 | 2.9e-17 | 62.8 | DNA helicase Pif1, 2B domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。