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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003587`

染色体: Chr08 坐标: 38649659-38650988 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003587`
名称	SmilChr08G003587
描述	uncharacterized SmilChr08G003587
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38649659 - 38650988 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998457`
GeneID	`130998457`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998457`
原始查询	`LOC130998457`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998457

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779857.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779857.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779857.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779857.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779857.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38649664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr8:38649684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B33,B56,B96,D4
`Chr8:38649701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:38649708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B33,B56,B96,D4
`Chr8:38649722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:38649736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	71	A10,A2,A22,A24,A3,A7,B1,B108,B111,B115,B117,B124,B126,B131,B132,B134,B135,B20,B23,B3,B38,B39,B46,B47,B49,B5,B50,B53,B55,B56,B60,B7,B71,B8,B80,B9,B91,B94,B96,C1,C10,C11,C14,C18,C19,C21,C23,C30,C31,C34,C36,C43,C45,C48,C52,C56,C58,C6,C60,C61,C63,C67,C69,C82,C83,D11,D3,D5,D6,D7,D9
`Chr8:38649757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C23
`Chr8:38649772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C53
`Chr8:38649784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B43,C84,D4,D8
`Chr8:38649786`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr8:38649786`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D4
`Chr8:38649794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B27,B38,B39,B4,D6

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923874.1
ATGGCCTTGTTTCTTCTTCAAAATTCTACTAATGGGAAGCTCCATTATGGGACTATTACTGCTGCCATGGCGAAATGGGGGTGTTGTCGGAGCTCCGTCGCACGTTTTTGGCAGGCTACAAAAGAGGAACAAGCACGAGTGTGTAGGCCTTTATTCAATGAAGATGGGAGTGTGTTATTCGATGGCAAGATAGGGATTTTCCCTTTCACTAAGATGGTACCAGCCAAAAGAATAAGCAAGAATAGGCTGGCTGGAACAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998457
ATGGCCTTGTTTCTTCTTCAAAATTCTACTAATGGGAAGCTCCATTATGGGACTATTACTGCTGCCATGGCGAAATGGGGGTGTTGTCGGAGCTCCGTCGCACGTTTTTGGCAGGCTACAAAAGAGGAACAAGCACGAGTGTGTAGGCCTTTATTCAATGAAGATGGGAGTGTGTTATTCGATGGCAAGATAGGGATTTTCCCTTTCACTAAGATGGTACCAGCCAAAAGAATAAGCAAGAATAGGCTGGCTGGAACAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779857.1
MALFLLQNSTNGKLHYGTITAAMAKWGCCRSSVARFWQATKEEQARVCRPLFNEDGSVLFDGKIGIFPFTKMVPAKRISKNRLAGTMEDKPIQSITKQVMKDCYISKQLWPNGPNLQVNIYIYIQQDNARPHIKDSDPDWRAAATANGFDIRIVHQPPNSPDTNINDLGWFRAIQSLQVQSVATNEHELVKTVEKSFEELSPHTLNSVFLSLQGCITEIMKVRGQNCYKLPHMKKGMLARQGALPMALEVPKELVEECIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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