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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003609`

染色体: Chr08 坐标: 39237008-39241401 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003609`
名称	SmilChr08G003609
描述	uncharacterized SmilChr08G003609
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39237008 - 39241401 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998460`
GeneID	`130998460`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998460`
原始查询	`LOC130998460`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=29.8; qcov=0.183; evalue=4.33e-21; confidence=weak
Rice	`Os03g0643433` - identity=24.2; qcov=0.624; evalue=8.48e-36; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998460

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779862.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779862.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779862.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779862.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779862.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39237027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C84
`Chr8:39237034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C84
`Chr8:39237038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B111,B126,B44,C45,C65,C78
`Chr8:39237054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B115
`Chr8:39237054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr8:39237055`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	A1,A5,B104,B110,B120,B130,B21,B23,B32,B39,B4,B51,B61,B67,B75,B8,B86,B99,C15,C25,C34,C35,C40,C42,C43,C47,C49,C5,C59,C67,C75,C86,C9
`Chr8:39237058`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C51,C84
`Chr8:39237058`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C51,C84
`Chr8:39237060`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	35	A1,A5,B104,B110,B120,B130,B21,B23,B32,B39,B4,B51,B61,B67,B75,B8,B82,B86,B99,C1,C15,C25,C34,C35,C40,C42,C43,C47,C49,C5,C59,C67,C75,C86,C9
`Chr8:39237062`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A3,B111,B126,B44,C45,C65,C78
`Chr8:39237063`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	49	A4,A5,A9,B1,B103,B112,B115,B117,B118,B119,B120,B123,B125,B13,B131,B14,B17,B2,B25,B35,B36,B37,B38,B47,B55,B60,B68,B69,B70,B77,B79,B97,C14,C17,C22,C26,C52,C54,C63,C64,C66,C68,C71,C73,C8,C82,C87,C9,D9
`Chr8:39237067`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	57	A10,A3,A4,A9,B1,B103,B111,B112,B115,B117,B118,B119,B120,B123,B125,B126,B13,B131,B14,B17,B2,B25,B35,B36,B37,B38,B44,B47,B55,B60,B68,B69,B70,B77,B79,B97,C14,C17,C22,C26,C29,C45,C49,C52,C54,C63,C64,C65,C66,C68,C71,C73,C8,C82,C87,C9,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779862.1

974 aa

487

974

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 606-685 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779862.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	606	685	5.2e-15	56.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923879.1
ATGTGGTGCACTCATGAGGGTTTCTTGGATCAAGTCAGGGCTTCTTGGATTCTTCCTATTGATAGTCTTTGCCCGATGGTTAGAGTGATGAAGAAGCTGAAGCGTCTTCGTTCGGTTCTCAAGGCCTGGAACAGAGATACTTTTGGGAATTACAATATCGCCTTGGCTGAGCTGCACCAGGATCTGAGTTCCCTTCAGGAGGTTTCTTTGCAGGCTCGGATTGGCACGATTCTCATACGTAAATCTGAGCATCTGAGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998460
ATGTGGTGCACTCATGAGGGTTTCTTGGATCAAGTCAGGGCTTCTTGGATTCTTCCTATTGATAGTCTTTGCCCGATGGTTAGAGTGATGAAGAAGCTGAAGCGTCTTCGTTCGGTTCTCAAGGCCTGGAACAGAGATACTTTTGGGAATTACAATATCGCCTTGGCTGAGCTGCACCAGGATCTGAGTTCCCTTCAGGAGGTTTCTTTGCAGGCTCGGATTGGCACGATTCTCATACGTAAATCTGAGCATCTGAGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779862.1
MWCTHEGFLDQVRASWILPIDSLCPMVRVMKKLKRLRSVLKAWNRDTFGNYNIALAELHQDLSSLQEVSLQARIGTILIRKSEHLRQHSRITWLSDGGMNTRFFHSMVKWHRSGQSIKKLSIDGVISEDTATMAAHVVGFYKALFFEPASGLVDRSWISNFIPNSVSSAHSAMLTTPHSADDIRLVVFSMDKDSAPSSDGFNGAFFQHSWDVVGEDMVAIADAILVYDYRPIVLGNFFFKVITKILASRLNAVAAEIVSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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