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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003622`

染色体: Chr08 坐标: 39404943-39407804 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003622`
名称	SmilChr08G003622
描述	uncharacterized SmilChr08G003622
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39404943 - 39407804 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998462`
GeneID	`130998462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998462`
原始查询	`LOC130998462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsABCF1; symbol=OsABCF1; hit=Os02g0826500; species=rice; confidence=low
产物	OsABCF1; symbol=OsABCF1; hit=Os02g0826500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G64550` (ABCF3) ral control non-repressible 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842763] identity=82.5; qcov=0.424; evalue=9.2e-72; confidence=low
Rice	`Os02g0826500` (OsABCF1) - identity=87.7; qcov=0.378; evalue=2.21e-73; confidence=low
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF00005 (ABC_tran); PF05004 (IFRD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057779864.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057779864.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779864.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779864.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39404948`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B111,B122,B71,B79
`Chr8:39405049`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr8:39405049`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr8:39405054`	`CT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B18,B28,B46,C87
`Chr8:39405089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr8:39405091`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A19,B111,B13,B38,B44,B58,C26,C38,C39,C52,C68,D9
`Chr8:39405093`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A18,A19,B111,B114,B118,B120,B13,B38,B44,B58,B64,B96,C10,C2,C23,C24,C26,C38,C39,C44,C52,C68,C71,C72,D9
`Chr8:39405097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:39405119`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B115
`Chr8:39405119`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B115
`Chr8:39405129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,C30,C35,C87
`Chr8:39405138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779864.1

323 aa

162

323

ABC_tran

AAA

IFRD

PF00005 ABC_tran 85-201 aa PF00004 AAA 86-201 aa PF05004 IFRD 235-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779864.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	85	201	2.4e-19	71.0	ABC transporter
`XP_057779864.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	86	201	0.00012	23.3	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057779864.1`	Pfam	`PF05004`	IFRD	Repeat	235	270	4.3e-06	26.6	Interferon-related developmental regulator (IFRD)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923881.1
ATGAGCACCAAACCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCCACCGTTCTCTCCTCTTCCACCTGCCTTACTCCCTTCAAACCGGGCATCACTGTCGCCGCCAGCCCCCATCCTCGCCGCCATTCTCCACCGTCCTCGCCGCCGTGTAGCTGTTCGCGCCGCCGTCCTCGCCGCTGAGGCCCCCTATCCCTTTCTCTTCCGCGAATAGCAGCGGTCCGAGGCGCCGCCGTTGATGTATCCTTCTCTGAAACTCCGGCGCTGCTGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998462
ATGAGCACCAAACCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCCACCGTTCTCTCCTCTTCCACCTGCCTTACTCCCTTCAAACCGGGCATCACTGTCGCCGCCAGCCCCCATCCTCGCCGCCATTCTCCACCGTCCTCGCCGCCGTGTAGCTGTTCGCGCCGCCGTCCTCGCCGCTGAGGCCCCCTATCCCTTTCTCTTCCGCGAATAGCAGCGGTCCGAGGCGCCGCCGTTGATGTATCCTTCTCTGAAACTCCGGCGCTGCTGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779864.1
MSTKPPLSLSLPPFSPLPPALLPSNRASLSPPAPILAAILHRPRRRVAVRAAVLAAEAPYPFLFREXQRSEAPPLMYPSLKLRRCCLVGPNGIGKSTILKLISGELQPSSGTVFRSAKVRIAVFNQHHVDGLDLFSNPLLYMMRCFPGVPEQKLRGHLGSLGITGNLALQPMYTLSGGQKSRVAFAKITFKKPHILLLDELSNHLVCYIAAAVSHSCYPSWMPNLIMDIAMMCSQLLQCLAVIAFVGGEDPEQTEKSMHI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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