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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003668`

染色体: Chr08 坐标: 40545083-40546574 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003668`
名称	SmilChr08G003668
描述	uncharacterized SmilChr08G003668
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	40545083 - 40546574 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998471`
GeneID	`130998471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998471`
原始查询	`LOC130998471`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36.5; qcov=0.466; evalue=1.01e-40; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779874.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057779874.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779874.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779874.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779874.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:40545088`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	47	A18,A23,A3,A4,A8,B101,B103,B106,B112,B115,B131,B132,B134,B2,B22,B23,B41,B42,B54,B55,B57,B63,B71,B81,B83,B89,B93,B95,B98,C12,C19,C2,C3,C48,C6,C61,C69,C70,C72,C77,C8,C80,C82,C84,C85,D5,D8
`Chr8:40545106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C20
`Chr8:40545156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C32,C45,C59,C62
`Chr8:40545169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B22,D6
`Chr8:40545192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,D5
`Chr8:40545213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B49,C32,C52,C68
`Chr8:40545235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B111,B79,C43
`Chr8:40545299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr8:40545302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A6,C20
`Chr8:40545302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C20
`Chr8:40545323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B67,B74,B97
`Chr8:40545344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779874.1

459 aa

230

459

DUF7769

PF24964 DUF7769 6-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779874.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	6	60	5.7e-09	36.2	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923891.1
ATGGTGAAAAAAGATCTCTCTAACAGTGATAGGAATAAGATAGTGCAGTTTCTTCTCTCTAACTTGAAGAATGGCAAGCCTAGATACAGCTCCATGAAGGAGGCAGCATCCGTCTTCAACTCCTCCCAACGCACTGTTGCTCGTCTTTGGGCGGCTGCGAAGAAACAAAGGGAAAATGGTGAGGAAATATATTTAACAAATGCAAAACCATGGGCTGCACGAAGAAAAAGAATAAGCGTCGACATAGAGCTTATTCAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998471
ATGGTGAAAAAAGATCTCTCTAACAGTGATAGGAATAAGATAGTGCAGTTTCTTCTCTCTAACTTGAAGAATGGCAAGCCTAGATACAGCTCCATGAAGGAGGCAGCATCCGTCTTCAACTCCTCCCAACGCACTGTTGCTCGTCTTTGGGCGGCTGCGAAGAAACAAAGGGAAAATGGTGAGGAAATATATTTAACAAATGCAAAACCATGGGCTGCACGAAGAAAAAGAATAAGCGTCGACATAGAGCTTATTCAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779874.1
MVKKDLSNSDRNKIVQFLLSNLKNGKPRYSSMKEAASVFNSSQRTVARLWAAAKKQRENGEEIYLTNAKPWAARRKRISVDIELIQSLELHKRSTIRRLAVGINQSKSTIWRWVNKGQIRAHSSAIKPDLTAPNKLLRLRFSLEALEFDRIMLDLKFKAMDNTIHIDEKWFYITKAAHRFYLTPAEGDSHRTCKSKAFIKKVMFVCAICRPIFSDSGECLFDGKIGIFPLTEQVPAKRNNKNRPVGTMETKLIQSVTKEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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