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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003812`

染色体: Chr08 坐标: 44288015-44290880 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003812`
名称	SmilChr08G003812
描述	probable serine/threonine-protein kinase PBL18
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	44288015 - 44290880 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998523`
GeneID	`130998523`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998523`
原始查询	`LOC130998523`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable serine/threonine-protein kinase PBL18
产物	probable serine/threonine-protein kinase PBL18
Arabidopsis	`AT5G47070` (AT5G47070) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834753] identity=69.1; qcov=0.433; evalue=1.21e-34; confidence=low
Rice	`Os09g0533600` (OsRLCK278) - identity=55.8; qcov=0.504; evalue=1.21e-33; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998523

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779920.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779920.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779920.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779920.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779920.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:44288045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr8:44288065`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C61
`Chr8:44288065`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C61
`Chr8:44288077`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A1,B13,B6,B77,C51,C75
`Chr8:44288088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr8:44288103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr8:44288108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B105,B137,B51,C35
`Chr8:44288122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr8:44288150`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A1,A21,A23,A8,B100,B104,B106,B107,B126,B132,B133,B138,B15,B23,B42,B43,B47,B50,B63,B76,C13,C17,C19,C3,C32,C45,C47,C61,C68,C7,C74,C77,C85,D11,D3,D8
`Chr8:44288154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:44288159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A8,B113,B122,B123,B128,B45,C25,C34,C63,C67,C82,D6
`Chr8:44288168`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	132	A13,A16,A18,A2,A21,A22,A23,A25,A4,A5,A7,A8,A9,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B109,B11,B112,B113,B114,B115,B118,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B135,B137,B138,B139,B14,B16,B17,B19,B23,B24,B26,B3,B32,B33,B34,B36,B4,B40,B44,B45,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B6,B64,B65,B67,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B77,B78,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B93,B97,B98,B99,C13,C14,C15,C16,C17,C2,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C40,C42,C43,C46,C49,C5,C54,C56,C57,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C71,C72,C77,C8,C80,C82,D1,D10,D11,D3,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779920.1

224 aa

112

224

PK_Tyr_Ser-Thr

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 112-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779920.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	112	178	3e-07	30.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923937.1
ATGGCTGCGCAGGGCAGCGCTTCAGGGGCAGGGCTGTGCAGAGCAGCGCTTCGGTGCAGGGCTGCACCGAGCAGTGCTGCGGGGCAAGGTTGCGTGGAGCAGCGTTTCCGGGCTAGAGCTGCGCTGAGGCAGGGCTACGCTGGCCAAGGCTGCGCCAGAGCAGACGAGCGCATCCGGCGAGCGCAGCACTTCCGAGCTGGGCGCCTGTGTTGCGCTGACCTCACCAAAGGGACACAAGGACCTGCAAACCAAGAATTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998523
ATGGCTGCGCAGGGCAGCGCTTCAGGGGCAGGGCTGTGCAGAGCAGCGCTTCGGTGCAGGGCTGCACCGAGCAGTGCTGCGGGGCAAGGTTGCGTGGAGCAGCGTTTCCGGGCTAGAGCTGCGCTGAGGCAGGGCTACGCTGGCCAAGGCTGCGCCAGAGCAGACGAGCGCATCCGGCGAGCGCAGCACTTCCGAGCTGGGCGCCTGTGTTGCGCTGACCTCACCAAAGGGACACAAGGACCTGCAAACCAAGAATTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779920.1
MAAQGSASGAGLCRAALRCRAAPSSAAGQGCVEQRFRARAALRQGYAGQGCARADERIRRAQHFRAGRLCCADLTKGTQGPANQEFENFQNFRVFSFSELKQATNNFSRLLKIGEDGFGSVYKGTIKPLDGNSSDPTLVAIKKLNGDGFQGHKQWVAEVQFLGVVEIPNLVKLIGYCGVDGERHYKKTYYQTRPPVKNSTDGAAAGNLPLLIGSSLTTATVRRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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