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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003853`

染色体: Chr08 坐标: 45058548-45059383 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003853`
名称	SmilChr08G003853
描述	copper transporter 4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	45058548 - 45059383 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998536`
GeneID	`130998536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998536`
原始查询	`LOC130998536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	copper transporter 4-like
产物	copper transporter 4-like
Arabidopsis	`AT2G37925` (COPT4) copper transporter 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818369] identity=50; qcov=0.632; evalue=2.82e-31; confidence=medium
Rice	`Os01g0770700` (COPT1) - identity=43; qcov=0.695; evalue=8.43e-25; confidence=medium
GO	GO:0005375 (copper ion transmembrane transporter activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006878 (intracellular copper ion homeostasis); GO:0035434 (copper ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF04145 (Ctr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057779934.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057779934.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057779934.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779934.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:45058728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,C16,C39,C67
`Chr8:45058890`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr8:45058890`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr8:45058915`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	130	A11,A13,A14,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A6,B1,B101,B106,B107,B108,B110,B111,B115,B119,B120,B124,B126,B129,B132,B136,B137,B139,B140,B15,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B47,B48,B5,B52,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B7,B74,B76,B77,B79,B80,B83,B84,B85,B86,B93,B94,B96,B97,C10,C11,C13,C14,C16,C18,C19,C26,C3,C30,C32,C37,C4,C43,C45,C47,C5,C52,C54,C56,C57,C6,C61,C65,C68,C69,C7,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D2,D4,D7,D8
`Chr8:45058917`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	133	A11,A13,A14,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A6,B1,B101,B106,B107,B108,B110,B111,B115,B119,B120,B124,B126,B129,B132,B136,B137,B139,B140,B15,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B47,B48,B5,B52,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B7,B74,B76,B77,B79,B80,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B93,B94,B95,B96,B97,C10,C11,C13,C14,C16,C18,C19,C20,C26,C3,C30,C32,C37,C4,C43,C45,C47,C5,C52,C54,C56,C57,C6,C61,C65,C68,C69,C7,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D2,D4,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779934.1

174 aa

174

Ctr

PF04145 Ctr 66-105 aa PF04145 Ctr 113-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779934.1`	Pfam	`PF04145`	Ctr	Family	66	105	8.7e-20	72.5	Ctr copper transporter family
`XP_057779934.1`	Pfam	`PF04145`	Ctr	Family	113	163	8.7e-20	72.5	Ctr copper transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923951.1
ATGAACTCTCTATTCAATAGTACAACTTCCCATTACTTATTTAAGTCCAAATCTTCACCAATTCAAATCACCAAAATTAAAACCAATTCATCAAATTTGATTTTGCAGCTCTTCACAACACCATGTCCTCCGCGGCCCCGCCGCCTCTGCCGCCAGGCCGCCCACATCCACCACCACCACCCGTTTCACGTGGCCTTTTACTGGTGCAAAGAGGCCCAGTTCCTGTTTCCGGGTTGGCCCGATAACAAGCCGGGCATGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998536
ATGAACTCTCTATTCAATAGTACAACTTCCCATTACTTATTTAAGTCCAAATCTTCACCAATTCAAATCACCAAAATTAAAACCAATTCATCAAATTTGATTTTGCAGCTCTTCACAACACCATGTCCTCCGCGGCCCCGCCGCCTCTGCCGCCAGGCCGCCCACATCCACCACCACCACCCGTTTCACGTGGCCTTTTACTGGTGCAAAGAGGCCCAGTTCCTGTTTCCGGGTTGGCCCGATAACAAGCCGGGCATGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779934.1
MNSLFNSTTSHYLFKSKSSPIQITKIKTNSSNLILQLFTTPCPPRPRRLCRQAAHIHHHHPFHVAFYWCKEAQFLFPGWPDNKPGMYAVSLVFVFALAIFAEFLSNLNLVKPGSNRAAMVFFQTGFHAVRAGFSYLVMLAVMSYNGGVFIAAVLGHAIGYVMFGSGLRKGTKPN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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