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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003857`

染色体: Chr08 坐标: 45225697-45234606 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003857`
名称	SmilChr08G003857
描述	cyclase-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	45225697 - 45234606 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998538`
GeneID	`130998538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998538`
原始查询	`LOC130998538`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclase-like protein 2
产物	cyclase-like protein 2
Arabidopsis	`AT4G35220` (AT4G35220) Cyclase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829675] identity=62.6; qcov=0.878; evalue=4.85e-42; confidence=medium
Rice	`Os09g0110300` (OsCYL4) - identity=73; qcov=0.679; evalue=2.24e-41; confidence=medium
GO	GO:0004061 (arylformamidase activity); GO:0019441 (GO:0019441)
KEGG	-
Pfam	PF04199 (Cyclase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057779937.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057779937.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057779937.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779937.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:45233788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B89,C70
`Chr8:45233974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B25,B73
`Chr8:45234412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B128,B61,C10,C84
`Chr8:45234434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:45234436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C39,C67
`Chr8:45234523`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C23
`Chr8:45234523`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C23
`Chr8:45234582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779937.1

131 aa

131

Cyclase

PF04199 Cyclase 47-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779937.1`	Pfam	`PF04199`	Cyclase	Family	47	112	6.3e-09	36.9	Putative cyclase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923954.1
TTTGCAACCCGAACAAGGGCATCAGCATCTACTACAACCGGATTGAGGCTAGGGCTTTCTACCAGGGCCAGTGATTCTCCACCATCGAGTTGCAGAAGTTCTATCAGGGGAAGAAGAACACCAGAACTGAAGAATGGCTCCGACTACAATTTCTCTGAGCTGAAGCTGCTGGCTCACACCGGAACTCATGTCGACGCGCCGGGCCATTTCTACGACAACTACTTTGACAGAGGGTTTGATGTCGATACCCTTGACCTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998538
TTTGCAACCCGAACAAGGGCATCAGCATCTACTACAACCGGATTGAGGCTAGGGCTTTCTACCAGGGCCAGTGATTCTCCACCATCGAGTTGCAGAAGTTCTATCAGGGGAAGAAGAACACCAGAACTGAAGAATGGCTCCGACTACAATTTCTCTGAGCTGAAGCTGCTGGCTCACACCGGAACTCATGTCGACGCGCCGGGCCATTTCTACGACAACTACTTTGACAGAGGGTTTGATGTCGATACCCTTGACCTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779937.1
FATRTRASASTTTGLRLGLSTRASDSPPSSCRSSIRGRRTPELKNGSDYNFSELKLLAHTGTHVDAPGHFYDNYFDRGFDVDTLDLRVLNGAVLLVDVPRDKNITDQVMKSINIPKGVKRVLFRTLNTDRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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