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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003878`

染色体: Chr08 坐标: 45968188-45968784 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003878`
名称	SmilChr08G003878
描述	histone deacetylase HDT2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	45968188 - 45968784 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998547`
GeneID	`130998547`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998547`
原始查询	`LOC130998547`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase HDT2-like
产物	histone deacetylase HDT2-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998547

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779945.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057779945.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057779945.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057779945.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057779945.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:45968192`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A20,B89,C54
`Chr8:45968192`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A20,B89,C54
`Chr8:45968196`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A20,B89,C54
`Chr8:45968196`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A20,B89,C54
`Chr8:45968199`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A20,B89,C54
`Chr8:45968199`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A20,B89,C54
`Chr8:45968217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B89,C54
`Chr8:45968230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A23,A25,B18,B28,B37,B42,B43,B87,C31,C37,C57
`Chr8:45968234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B89,C54
`Chr8:45968242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	65	A10,A18,A2,A22,A4,A5,A7,B10,B101,B110,B117,B124,B135,B136,B17,B21,B25,B33,B35,B38,B39,B40,B49,B58,B59,B62,B63,B65,B66,B70,B76,B8,B81,B82,B84,B86,B89,B9,B97,B99,C1,C12,C23,C27,C3,C32,C35,C40,C48,C51,C52,C53,C55,C57,C58,C64,C66,C68,C74,C76,C84,C87,D3,D5,D8
`Chr8:45968267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B89,C54,C86
`Chr8:45968295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B89,C54,C86

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923962.1
ATGGAGGAACATGAAGTCGCGAGAGCAACCGCGGAGGCAAAACAACCGGAGGAGCAGGAAGAAGAAGAGCCTGAGGCCACTCCACTTGTGAAGAAGATTAGGAAAGCCCATTCGGGCAAGGGAGCAAAGGCAACTCGAACACGGTCCGTTGTAGCTCCACCGCCACCAGCTCAAATTCAACCACCACTGCAAGCTCCTGAAGCATCTATGCAAGAAGGGAGAACCGCCTCCGAAGACACGGAGGAGGAAGAAGGAGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998547
ATGGAGGAACATGAAGTCGCGAGAGCAACCGCGGAGGCAAAACAACCGGAGGAGCAGGAAGAAGAAGAGCCTGAGGCCACTCCACTTGTGAAGAAGATTAGGAAAGCCCATTCGGGCAAGGGAGCAAAGGCAACTCGAACACGGTCCGTTGTAGCTCCACCGCCACCAGCTCAAATTCAACCACCACTGCAAGCTCCTGAAGCATCTATGCAAGAAGGGAGAACCGCCTCCGAAGACACGGAGGAGGAAGAAGGAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779945.1
MEEHEVARATAEAKQPEEQEEEEPEATPLVKKIRKAHSGKGAKATRTRSVVAPPPPAQIQPPLQAPEASMQEGRTASEDTEEEEGEEEEKAGEEEAGEEEGAEAVQDEEVEILTPQIKRPRVKRKLDISKPLLPVKAKPTTVGSKTRTKGEQSKKKKPTAVEKGKGKEMKIPTEVDAERTETIENSNSDDIVAPAKPV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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