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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003903`

染色体: Chr08 坐标: 46320656-46321323 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003903`
名称	SmilChr08G003903
描述	gluconokinase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	46320656 - 46321323 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998553`
GeneID	`130998553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998553`
原始查询	`LOC130998553`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gluconokinase-like
产物	gluconokinase-like
Arabidopsis	`AT2G16790` (AT2G16790) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816180] identity=53.3; qcov=0.854; evalue=1.15e-32; confidence=medium
Rice	`Os06g0114650` - identity=51; qcov=0.846; evalue=5.8e-31; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0046177 (GO:0046177); GO:0046316 (gluconokinase activity)
KEGG	smil00030 (Pentose phosphate pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057779952.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779952.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779952.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779952.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:46320685`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B129,B72,C13
`Chr8:46320685`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B129,B72,C13
`Chr8:46320705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B48,B65
`Chr8:46320778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B72,C13
`Chr8:46320868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C45
`Chr8:46320921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:46320948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B10,B106,B26,C45
`Chr8:46320959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr8:46321220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923969.1
CGTGAGTCTTGCACTTGCATCTCCTCTTCTTATTACTTCACTTCATCTTAATTAATAATGTAAATTTTTGTTGCAGAACTATTGGGGCGATGCTGGCACAAGTGATGAATGCCCGTTTTCTTGATGCTGATGACTACCACCCACAGTCGAACAAAGACAAGATGAAGGGCGGGATCCCTCTTTCAGACGAAGATCGCATCCCATGGCTTGAAACTCTACGCGATGCCTTAAGAGTAAGCTTGGAAAATGGGGAAACTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998553
ATGCTGGCACAAGTGATGAATGCCCGTTTTCTTGATGCTGATGACTACCACCCACAGTCGAACAAAGACAAGATGAAGGGCGGGATCCCTCTTTCAGACGAAGATCGCATCCCATGGCTTGAAACTCTACGCGATGCCTTAAGAGTAAGCTTGGAAAATGGGGAAACTGCCATTCTTAGATGTTCAGCTCTGAAGAAGCACTACAGAGAAATTCTTCGATGTGCAGATGTAGAGTATGTAGGTGGAGCAGCCTCATGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779952.1
MLAQVMNARFLDADDYHPQSNKDKMKGGIPLSDEDRIPWLETLRDALRVSLENGETAILRCSALKKHYREILRCADVEYVGGAASCGVRFVLLSVDAVSISPCLLCAAVSISLSRVSFGPLPL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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