Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003905`

染色体: Chr08 坐标: 46418122-46419960 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003905`
名称	SmilChr08G003905
描述	uncharacterized SmilChr08G003905
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	46418122 - 46419960 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998554`
GeneID	`130998554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998554`
原始查询	`LOC130998554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=27.18; qcov=0.171; evalue=2.93e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998554

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779953.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779953.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057779953.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057779953.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:46418164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B111,B39,C48,C66
`Chr8:46418169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B41,B71,B89,C70
`Chr8:46418169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70
`Chr8:46418194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,B97
`Chr8:46418209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B91
`Chr8:46418234`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr8:46418234`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr8:46418238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr8:46418244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B56,B96,D4
`Chr8:46418245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr8:46418347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr8:46418349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B51,B8,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923970.1
ATGATGTTCCCGAACAACCTGAACCTCCGACCGTCAGCCATAGTACTACCGGAGATCACTGGAAATTGGGAGCTGAAGCATACACTAATTCAAATCTTGCCCAAGTACAGTGATATGCCCGGGGAGGACCCTCAAAGGCATCTCCAGGACTTTGAGATGGCATGTGGAACAGTGCGCACCGCTAGTCAAGCCCTTGAAGGAGCGAGGGAGTGGTTGTACGATTTGCCCGAAGGAAGCATTCGGACCTGGCAGGAGTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998554
ATGATGTTCCCGAACAACCTGAACCTCCGACCGTCAGCCATAGTACTACCGGAGATCACTGGAAATTGGGAGCTGAAGCATACACTAATTCAAATCTTGCCCAAGTACAGTGATATGCCCGGGGAGGACCCTCAAAGGCATCTCCAGGACTTTGAGATGGCATGTGGAACAGTGCGCACCGCTAGTCAAGCCCTTGAAGGAGCGAGGGAGTGGTTGTACGATTTGCCCGAAGGAAGCATTCGGACCTGGCAGGAGTTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779953.1
MMFPNNLNLRPSAIVLPEITGNWELKHTLIQILPKYSDMPGEDPQRHLQDFEMACGTVRTASQALEGAREWLYDLPEGSIRTWQELQSKFLEKHFPATRIQNLRTRISNIKMGSREILYEYWGRFKQMLAKCPQHQIPDHDLNRYFVGGLRRQDRQWLHAAYGGSILNKSAAEAFKLIADMAEESRDEEGTIVRTAPVPNPSAQDDKLDKLCNMFEKFMTNQETSNQGTPNIRKPVKACQLCLANSHATDECPQLFEDEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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