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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003949`

染色体: Chr08 坐标: 47276931-47277746 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003949`
名称	SmilChr08G003949
描述	uncharacterized SmilChr08G003949
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47276931 - 47277746 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998565`
GeneID	`130998565`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998565`
原始查询	`LOC130998565`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0225900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0225900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=27.9; qcov=0.701; evalue=7.9e-10; confidence=low
Rice	`Os08g0225900` - identity=31.8; qcov=0.952; evalue=6.22e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998565

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779964.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779964.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779964.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779964.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779964.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47276933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:47276957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C27
`Chr8:47276962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B7,D3
`Chr8:47276963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr8:47276974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B85,C24
`Chr8:47277015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	196	A1,A15,A18,A19,A2,A22,A24,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B102,B103,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B12,B120,B124,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B135,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B60,B61,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B72,B73,B74,B78,B79,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C28,C30,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C55,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr8:47277038`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A4,B120,B126,B131,B140,B52,B67,B9,B90,C19,C31,C45,D8
`Chr8:47277042`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A4,B120,B126,B131,B140,B52,B67,B9,B90,C19,C31,C45,D8
`Chr8:47277070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,D6
`Chr8:47277093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D11
`Chr8:47277135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:47277151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B31,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923981.1
ATGTCTAATCCTCAAATATATCCCAACAATCCCATGAGTCAATCAGCCTCTTCATTTCAATTTTCATCCCAAGTGCATCCATCTCAGGGATTTCAGCCATACGGATATCCTCAGCAATGGTATCCCCCTCCAGGATTTTCCCCACAAGGATATCCTTCACAGGGGTTTATGTTTTTTGACTCTTCCAGGAGGACCAGTGTAGATGGGAGTGGTACTGATGGAGGCACACCATCATCAGGAAAGGCAGTTCAAGGTTTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998565
ATGTCTAATCCTCAAATATATCCCAACAATCCCATGAGTCAATCAGCCTCTTCATTTCAATTTTCATCCCAAGTGCATCCATCTCAGGGATTTCAGCCATACGGATATCCTCAGCAATGGTATCCCCCTCCAGGATTTTCCCCACAAGGATATCCTTCACAGGGGTTTATGTTTTTTGACTCTTCCAGGAGGACCAGTGTAGATGGGAGTGGTACTGATGGAGGCACACCATCATCAGGAAAGGCAGTTCAAGGTTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779964.1
MSNPQIYPNNPMSQSASSFQFSSQVHPSQGFQPYGYPQQWYPPPGFSPQGYPSQGFMFFDSSRRTSVDGSGTDGGTPSSGKAVQGLDNINLSAEPSSDDDEENTNMRRVFYSDAECEVLAQCYIDISIDSVVGNDQKMDKTWKRIAKAYNENRPANTPNRKFGVLKAHFYKMQKQVKWFSECYNRIASIWKSGANDADIMEMAQTEYKQHHGTKGFKYVGVWKLLKEVPKFAEVQGNVQASKRTKNTEGGAYTSSSTAEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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