当前解析结果
SmilChr08G003960| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003960 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003960 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003960 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 47515290 - 47515718 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998567 |
|---|---|
| GeneID | 130998567 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998567 |
| 原始查询 | LOC130998567 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998567 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779967.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057779967.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779967.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779967.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779967.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:47515339 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr8:47515360 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B135,B67,B68,C60 |
Chr8:47515371 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B17 |
Chr8:47515375 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B33,B49,C32,C53,C68 |
Chr8:47515397 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B137,C41,C53 |
Chr8:47515407 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 24 | B10,B112,B113,B122,B14,B16,B23,B34,B45,B58,B69,B73,B93,B99,C16,C23,C25,C34,C38,C46,C59,C63,C67,C87 |
Chr8:47515449 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr8:47515496 |
GAC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A1,A19,B123,B137,B73,C41,C55,C67 |
Chr8:47515506 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A1,A19,B123,B137,C41,C55,C67 |
Chr8:47515533 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B23,C16 |
Chr8:47515581 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,C41 |
Chr8:47515632 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,C41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。