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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003963`

染色体: Chr08 坐标: 47609982-47610329 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003963`
名称	SmilChr08G003963
描述	uncharacterized SmilChr08G003963
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47609982 - 47610329 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998568`
GeneID	`130998568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998568`
原始查询	`LOC130998568`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779968.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779968.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779968.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779968.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779968.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47610000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:47610027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B136,C33
`Chr8:47610040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42
`Chr8:47610136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B21,B58
`Chr8:47610156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:47610164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:47610174`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B110
`Chr8:47610174`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B110
`Chr8:47610210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:47610264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B80,C29,C38,C7
`Chr8:47610277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B28,B66
`Chr8:47610304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779968.1

115 aa

115

DUF8803

PF31073 DUF8803 53-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779968.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	53	114	1.5e-08	35.0	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923985.1
ATGAACAAAATGAATTTGGATTGGACAGAGGCAGGTCAGAACAGGAAGCCTAGCATCGAGGAGCTCGAGGAGATCCAACTTGAAGCCTATGAGAGTGCCTCATTCTACAAGGAAAAATTGAAGCTTGCCCATGATAGTCTAATCAGGGCAAAAAGCTTCGATACAGGGCAAATGGTACTCTTGTACCAAACTCGATGCAAGATTGTCGCGGGCAAACTCTCAACCAAGTGGGCCGGTCCATATGAAGTCAATGCCCAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998568
ATGAACAAAATGAATTTGGATTGGACAGAGGCAGGTCAGAACAGGAAGCCTAGCATCGAGGAGCTCGAGGAGATCCAACTTGAAGCCTATGAGAGTGCCTCATTCTACAAGGAAAAATTGAAGCTTGCCCATGATAGTCTAATCAGGGCAAAAAGCTTCGATACAGGGCAAATGGTACTCTTGTACCAAACTCGATGCAAGATTGTCGCGGGCAAACTCTCAACCAAGTGGGCCGGTCCATATGAAGTCAATGCCCAATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779968.1
MNKMNLDWTEAGQNRKPSIEELEEIQLEAYESASFYKEKLKLAHDSLIRAKSFDTGQMVLLYQTRCKIVAGKLSTKWAGPYEVNAQYLSGAVEIKDPKTRSIFKVNGHRLKAYYG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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