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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003971`

染色体: Chr08 坐标: 47731005-47732498 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003971`
名称	SmilChr08G003971
描述	E3 ubiquitin-protein ligase UPL2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47731005 - 47732498 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998570`
GeneID	`130998570`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998570`
原始查询	`LOC130998570`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase UPL2-like
产物	E3 ubiquitin-protein ligase UPL2-like
Arabidopsis	`AT1G31150` (AT1G31150) K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=33.3; qcov=0.293; evalue=1.2e-09; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998570

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779971.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779971.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779971.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779971.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779971.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47731069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr8:47731150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:47731967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C87
`Chr8:47731992`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A3,C25
`Chr8:47731992`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A3,C25
`Chr8:47732013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C25
`Chr8:47732060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D4
`Chr8:47732069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:47732079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C25
`Chr8:47732094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A14,A5,B12,B78,C27,C37
`Chr8:47732115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C67
`Chr8:47732139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

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cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923988.1
ATGACCAAGCGCAAGGCTTCACAAACCGGCTCGACCTCCAAGCGCCAGCGCGCTGCAGAATCCGGTGAGGAAAAAGCCGGATCTGGAGTTTCTGGAAGCGTCATAGATATTTGCAAAGAAATCAATGCAGATGAGAGTTCCGGATCTGAGGAACAACAATCACCGATCCGGGTGGTGACTCTTCCAACCACGGCCGAAGAAGCCGACGAGGAAGACGAAGCCGCCGAGGAAGAAGATTCTGGAGAGGAAGAAGAAGCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998570
ATGACCAAGCGCAAGGCTTCACAAACCGGCTCGACCTCCAAGCGCCAGCGCGCTGCAGAATCCGGTGAGGAAAAAGCCGGATCTGGAGTTTCTGGAAGCGTCATAGATATTTGCAAAGAAATCAATGCAGATGAGAGTTCCGGATCTGAGGAACAACAATCACCGATCCGGGTGGTGACTCTTCCAACCACGGCCGAAGAAGCCGACGAGGAAGACGAAGCCGCCGAGGAAGAAGATTCTGGAGAGGAAGAAGAAGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779971.1
MTKRKASQTGSTSKRQRAAESGEEKAGSGVSGSVIDICKEINADESSGSEEQQSPIRVVTLPTTAEEADEEDEAAEEEDSGEEEEAVEEEESGEEEEADEEDEAAEEEDYGEEEESEEEENSKESAGEDEDDLSSTVQWQYLRKGMEKIKHKVNITGKENNIEIINNVLEGDNVYRELQESVFSDFLKLPSRVSRSGQCLHLMISRQIAGKSKPDETALFFIVDGYVTRFSRIEFFFMTGLKFGSSNFNPYADHIILENS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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