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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004042`

染色体: Chr08 坐标: 48894795-48899399 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004042`
名称	SmilChr08G004042
描述	uncharacterized SmilChr08G004042
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48894795 - 48899399 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998591`
GeneID	`130998591`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998591`
原始查询	`LOC130998591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=25.1; qcov=0.547; evalue=6.12e-19; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=23.9; qcov=0.811; evalue=4.28e-33; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998591

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779989.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779989.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779989.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779989.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779989.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48894795`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	40	A7,B105,B107,B112,B115,B121,B122,B133,B135,B137,B14,B18,B20,B23,B25,B38,B39,B51,B53,B59,B66,B70,B86,B89,B93,B97,C13,C18,C22,C25,C27,C35,C38,C4,C43,C44,C53,C54,C55,C86
`Chr8:48894799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:48894802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B61,C19,C30,C31
`Chr8:48894809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B86,B9
`Chr8:48894838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:48894903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr8:48894952`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	134	A1,A13,A16,A18,A2,A21,A23,A24,A25,A4,A5,A7,A8,B1,B100,B102,B103,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B19,B20,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B37,B41,B44,B45,B47,B5,B55,B58,B59,B6,B62,B63,B65,B67,B68,B7,B70,B73,B80,B81,B83,B84,B86,B87,B90,B93,B94,B95,C1,C10,C11,C13,C16,C17,C2,C20,C21,C22,C25,C26,C27,C3,C30,C32,C33,C36,C40,C42,C53,C54,C55,C56,C57,C61,C62,C63,C67,C68,C69,C70,C74,C75,C76,C80,C83,C84,D10,D11,D2,D4,D6,D7
`Chr8:48894960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B54,C9
`Chr8:48894960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C9
`Chr8:48895005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B61,C19,C31
`Chr8:48895194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C31,D10
`Chr8:48895196`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B115,B137,B21,B61,B64,B82,C23,C26,C32,C68,C74,C77,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924006.1
ATGCCATGTCTCTTCTTCGTCATTACTGTGTCACTTATAAGCCGTGTCTGCTTGTCTTTGGGTTTAGTTCCCGTTTATCAGAACAGTCGGGGTGGCAGAAGGTCTAACATTTGGGTTTTTGCGGATATTTCTATTGCTTCTACTGTCGTGTTATCTACTACTCAGTCTTCGGTTGGCCCGTTTGTGACGGGGAATTTTCTCATCATTGGTGACTTTAACTCTATTTTGGGTGCTCATGAGCGTCTTGGCAGGCGGATTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998591
ATGCCATGTCTCTTCTTCGTCATTACTGTGTCACTTATAAGCCGTGTCTGCTTGTCTTTGGGTTTAGTTCCCGTTTATCAGAACAGTCGGGGTGGCAGAAGGTCTAACATTTGGGTTTTTGCGGATATTTCTATTGCTTCTACTGTCGTGTTATCTACTACTCAGTCTTCGGTTGGCCCGTTTGTGACGGGGAATTTTCTCATCATTGGTGACTTTAACTCTATTTTGGGTGCTCATGAGCGTCTTGGCAGGCGGATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779989.1
MPCLFFVITVSLISRVCLSLGLVPVYQNSRGGRRSNIWVFADISIASTVVLSTTQSSVGPFVTGNFLIIGDFNSILGAHERLGRRIPATTPCLEFREFIDDHSLVQPETTGSFFTWTDRRCFPFSIESVLDRDLLYQDFYDLWTSTSVLVLSKLESDHSPILLRCLDSEVMKKLKRLRPALKTWNKEVFGNYNTALTDLQQDLSALQQSIDAMGYSEVFFDQEVALQAEMGTLLMFFHSMVKWRRASHKIKHFNINGVLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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