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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004072`

染色体: Chr08 坐标: 49357754-49360920 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004072`
名称	SmilChr08G004072
描述	DNA replication licensing factor MCM4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49357754 - 49360920 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998600`
GeneID	`130998600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998600`
原始查询	`LOC130998600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA replication licensing factor MCM4-like
产物	DNA replication licensing factor MCM4-like
Arabidopsis	`AT2G16440` (MCM4) Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816142] identity=70.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0544450` (OsMCM4) - identity=72.9; qcov=0.92; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000727 (double-strand break repair via break-induced replication); GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006268 (GO:0006268); GO:0006271 (DNA strand elongation involved in DNA replication); GO:0017116 (single-stranded DNA helicase activity); GO:0042555 (MCM complex); GO:1902975 (mitotic DNA replication initiation)
KEGG	smil03030 (DNA replication - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00493 (MCM); PF07728 (AAA_5); PF14551 (MCM_N); PF17207 (MCM_OB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779997.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057779997.1`
3	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057779997.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779997.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779997.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779997.1

573 aa

286

573

MCM_N

MCM_OB

MCM

AAA_5

PF14551 MCM_N 128-216 aa PF17207 MCM_OB 223-352 aa PF00493 MCM 411-567 aa PF07728 AAA_5 468-565 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779997.1`	Pfam	`PF14551`	MCM_N	Domain	128	216	1.9e-15	57.8	MCM N-terminal domain
`XP_057779997.1`	Pfam	`PF17207`	MCM_OB	Domain	223	352	8.3e-40	136.2	MCM OB domain
`XP_057779997.1`	Pfam	`PF00493`	MCM	Domain	411	567	2.6e-69	233.5	MCM P-loop domain
`XP_057779997.1`	Pfam	`PF07728`	AAA_5	Domain	468	565	3.4e-06	27.8	AAA domain (dynein-related subfamily)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924014.1
TTCCCGCCAATTTGCTGCAGACAATTAGGCACTTTCCCTCGCTTCCCCTTTCGCCCTAACCGCTCTGCTCTCTCTCTCACCCAGTATCACCATTCCAGACACTCGTTCGCACGCTGAAGATCATGGCTTCCGATTCTTCTCCTGTCAACACGCACGACGGTCCGTCGTCTCCGGATGCGTGGCCGACGAGCCCAGTCAGCAACACAGTATCATCTCCTGGAGAGCGCTCGCGCCGGAAACGTGGCCGTCATTCCAGCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998600
ATGGCTTCCGATTCTTCTCCTGTCAACACGCACGACGGTCCGTCGTCTCCGGATGCGTGGCCGACGAGCCCAGTCAGCAACACAGTATCATCTCCTGGAGAGCGCTCGCGCCGGAAACGTGGCCGTCATTCCAGCTACGCTACGCCGTCACCGATGCCGTCAGGTTCGCGTGTCAGAACACCCGAGGCAACTCCAACGCCCTCTAGTAACGCTCGACGTCGTGGCCGAGGTAGGAGGCAGTCGACCACCCCTACTGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779997.1
MASDSSPVNTHDGPSSPDAWPTSPVSNTVSSPGERSRRKRGRHSSYATPSPMPSGSRVRTPEATPTPSSNARRRGRGRRQSTTPTAGATPTSNDDVPPSSDAGEGNEDEPPVVYVWGTNISVQDVNAAILRFLRHFREDPQQIEGKYMRMINHVIEMEGDSLDVDAQDVYDYDSDLYTKMVRYPLEVLAIFDMVLMDMVGRINPLFEKHIQARIFNLRSSTSMRNLNPSDVEKMVSLKGMIIRCSSIIPEIREAVFRCLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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